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酚氯仿法提取 DNA 主要步骤和原理
酚氯仿法提取 DNA 主要步骤:
1.将动物组织放在 1.5ml 的离心管中,分别用 75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。每个梯
度脱水时间为 5-10min
2.将组织放入研钵中,加入适量 DNA 裂解液( 300 μl),研磨后再加入 300 μlDNA裂解液
冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到 1.5ml 离心管,在管中加 10 μl蛋白酶 K ,用封口带将离
心管封口,放入摇床( 56℃,5h)。
4.加入等体积的 Tris 饱和酚( 500 μl),摇匀( 10min)。
5.离心: 12000R,7min,4℃。离心后分成上中下三层,上层为 DNA ,中层为蛋白质,下
层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制 Tris 饱和酚:氯仿:异戊醇 =25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入 Tris 饱和酚、氯仿和异戊醇混合液 450 μl,摇匀 10min。
9.离心: 12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液 400 μl(氯仿:异戊醇
=24:1)。
11.离心: 12000R,7min ,4 ℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入 2.5 倍经过 -20℃冷冻的 100%的酒精。 -20℃过夜。
13.将样品取出, 12000R,7min ,4 ℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀( DNA ),加 400 μl的 75%的经过 -20℃冷冻的酒精,反复吹打溶
解。
15.重复第 14 步骤 2 次(用 75%酒精洗三次)。
16.提取 DNA 完成。
溴氯仿法提取 DNA 的原理:
用酚抽提细胞 DNA 时,有什么作用?
使蛋白质变性,同时抑制了 DNase 的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与 DNA
联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而
DNA 溶于水相。
使用酚的优点: 1. 有效变性蛋白质; 2. 抑制了 DNase 的降解作用。
缺点: 1. 能溶解 10-15%的水,从而溶解一部分 poly (A )RNA 。2. 不能完全抑制 RNase
的活性。
氯仿的作用?
氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组 DNA 时,通常要在酚 -氯仿中加少许异戊醇,为什么?
异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气
泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA 的水相、中间的变性蛋白相
及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀 DNA 时,为什么加入单价的阳离子?
用乙醇沉淀 DNA 时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如 NaCl 或 NaAc ,Na+中和
DNA 分子上的负电荷,减少 DNA 分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白( DNP )可溶于水或浓盐溶液(如 1mol/L 氯化
钠),但在 0.14mol/L 氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白( RNP)则在
0.14mol/L 氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。
将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠( SDS)溶液,使 DNA 与蛋白质
分离开。加入固体氯化钠使其浓度达到 1mol/L ,使 DNA 溶解。加氯仿 -异戊醇去除蛋白
质,也可重复该步操作得较纯 DNA
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