酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理.pdfVIP

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酚氯仿法提取 DNA 主要步骤和原理 酚氯仿法提取 DNA 主要步骤: 1.将动物组织放在 1.5ml 的离心管中,分别用 75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。每个梯 度脱水时间为 5-10min 2.将组织放入研钵中,加入适量 DNA 裂解液( 300 μl),研磨后再加入 300 μlDNA裂解液 冲洗研磨棒。 3.将研磨好的组织液用移液枪加到 1.5ml 离心管,在管中加 10 μl蛋白酶 K ,用封口带将离 心管封口,放入摇床( 56℃,5h)。 4.加入等体积的 Tris 饱和酚( 500 μl),摇匀( 10min)。 5.离心: 12000R,7min,4℃。离心后分成上中下三层,上层为 DNA ,中层为蛋白质,下 层为有机质。 6.吸取上层液体加入新的离心管。 7.配制 Tris 饱和酚:氯仿:异戊醇 =25:24:1。 8.在含有上清液的离心管中加入 Tris 饱和酚、氯仿和异戊醇混合液 450 μl,摇匀 10min。 9.离心: 12000R,7min,4℃。 10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液 400 μl(氯仿:异戊醇 =24:1)。 11.离心: 12000R,7min ,4 ℃。 12.吸取上清液加入新的离心管,加入 2.5 倍经过 -20℃冷冻的 100%的酒精。 -20℃过夜。 13.将样品取出, 12000R,7min ,4 ℃离心。 14.弃上清,留白色沉淀( DNA ),加 400 μl的 75%的经过 -20℃冷冻的酒精,反复吹打溶 解。 15.重复第 14 步骤 2 次(用 75%酒精洗三次)。 16.提取 DNA 完成。 溴氯仿法提取 DNA 的原理: 用酚抽提细胞 DNA 时,有什么作用? 使蛋白质变性,同时抑制了 DNase 的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相。 使用酚的优点: 1. 有效变性蛋白质; 2. 抑制了 DNase 的降解作用。 缺点: 1. 能溶解 10-15%的水,从而溶解一部分 poly (A )RNA 。2. 不能完全抑制 RNase 的活性。 氯仿的作用? 氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。 最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中) 用酚-氯仿抽提细胞基因组 DNA 时,通常要在酚 -氯仿中加少许异戊醇,为什么? 异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气 泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA 的水相、中间的变性蛋白相 及下层有机溶剂相维持稳定。 用乙醇沉淀 DNA 时,为什么加入单价的阳离子? 用乙醇沉淀 DNA 时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如 NaCl 或 NaAc ,Na+中和 DNA 分子上的负电荷,减少 DNA 分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。 原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白( DNP )可溶于水或浓盐溶液(如 1mol/L 氯化 钠),但在 0.14mol/L 氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白( RNP)则在 0.14mol/L 氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。 将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠( SDS)溶液,使 DNA 与蛋白质 分离开。加入固体氯化钠使其浓度达到 1mol/L ,使 DNA 溶解。加氯仿 -异戊醇去除蛋白 质,也可重复该步操作得较纯 DNA

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