lncRNA的研究背景及其与疾病的关系长链非编码RNA(lncRNA)是一....docxVIP

精品 精品 IncRNA的研究背景及其与疾病的关系 长链非编码RNA(IncRNA是一类转录本长度超过 200nt的RNA分子，它们并 不编码蛋白，而是以RNA勺形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及 转录后调控等)调控基因的表达水平。 IncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”， 是RNA聚合酶II转录的副产 物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，IncRNA参与了 X染色体沉 默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要 的调控过程，IncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。 哺乳动物基 因组序列中4%~9的序列产生的转录本是IncRNA (相应的蛋白编码RNA勺比例 是1%，虽然近年来关于IncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分的IncRNA的 功能仍然是不清楚的。 生物学功能 许多IncRNA都具有保守的二级结构，剪切形式以及亚细胞定位，这种保守 性和特异性表明它们是具有功能的。但 IncRNA的功能相对于microRNA和蛋白 质的功能来说更加难以确定，因为目前并不能仅根据序列或者结构来推测它们 的功能。根据它们在基因组上相对于蛋白编码基因的位置，可以将其分为 ⑴ sen se, (2) an tise nse, (3) bidirect ion aI, (4) intronic, (5) in terge nic 这5种类型。这种位置关系对于推测IncRNA的功能有很大帮助。 r-— r- sense introrticl bidirectionalintergenicgantisense bidirectional intergenicg antisense 图1.根据IncRNA在基因组上的位置，可将其分为 5种类型：1. sense, 2. an tise nse, 3. bidirecti on al, 4. i ntro nic, 5. i nterge nic 。图中编码 RNA 和非编码RNA外显子分别用蓝色和红色表示。 近年来通过对已发现的IncRNA的研究表明，IncRNA能够在多种层面调控基 因的表达水平，其调控机制开始为人们所揭示(图 2)。 1 Tnwifriptlaniil IrtterfernriEze2. Induct rhromatiHi h i5W no mod ifk^ton sPnNUrlOfHmiII or/\rslact iTCTipw 帕秤 of wan bVthE5p4lc￡c^3meLieaua^e3-Modulate aketnatln spiking patterns4.Generate endo-$iRNA^/5.Miadijlat? protein activity\7, 1 Tnwifriptlaniil IrtterfernriEze 2. Induct rhromatiHi h i5W no mod ifk^ton s PnNUrlOf HmiII or /\r slact iTCTipw 帕秤 of wan bVthE5p4lc￡c^3me Lieaua^e 3-Modulate aketnatln spiking patterns 4.Generate endo-$iRNA^ / 5.Miadijlat? protein activity \ 7, A lrl?r protein klCAliUtliMI . Structural or□rganizalional role 图2. lncRNA的作用机制。根据今年来所发现的IncRNA的作用机制，IncRNA主 要可能具有以下几个方面的功能：1）通过在蛋白编码基因上游启动子区 （桔） 发生转录，干扰下游基因（蓝）的表达（如酵母中的 SER3基因）。2）通过抑 制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰，影响下游基因 （蓝） 表达（如小鼠中的p15AS o 3）通过与蛋白编码基因的转录本形成互补双链 （紫）， 进而干扰mRNA勺剪切，从而产生不同的剪切形式。4）通过与蛋白编码基因的 转录本形成互补双链（紫），进一步在 Dicer酶作用下产生内源性的siRNA,调 控基因的表达水平。5）通过结合到特定蛋白质 上，IncRNA转录本（绿）能够 调节相应蛋白的活性。6）作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体。 7） 通过结合到特定蛋白上，改变该蛋白的胞质定 位。8）作为小分子RNA如miRNA piRNA的前体分子转录（Jeremy E. Wilusz et al, 2009, Genes Dev. ）。 一般来说，IncRNA主要从以下三种层面实现对基因表达的调控： 表观遗传学调控 IncRNA招募染色质重构复合体到特定位点进而介导相