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第八章 真核生物基因 表达调控;教学目的:;第一节 概述
第二节 转录水平的调控
第三节 转录后加工水平的调控
第四节 翻译的调控;第一节 概述;原核与真核生物基因表达的差异;染色质结构
DNA的甲基化;第一节 概述
第二节 转录水平的调控
第三节 转录后加工水平的调控
第四节 翻译的调控;; 1 基因转录的顺式作用元件(cis-acting elements)
顺式作用元件:对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因;
通常不编码蛋白质,多位于基因旁侧或内含子中。
包括: 启动子、终止子、增强子、沉默子、静息子、转座子、效应元件等。
;1.1 启动子;;II型启动子组成;真核启动子含有不同的序列,不同序列的位置、种类、距离和方向都不完全相同;;;1.2 增强子 Enhancer
又称远端上游序列(far upstream sequence)。
最早SV40病毒中发现,可使旁侧基因转录提高100倍。
组成:100-200bp,单拷贝或多拷贝串连形式存在。
正性调控元件,转录因子结合,促进转录。
;;1.3 沉默子 silencer
负性调控元件, 转录因子结合抑制转录。
作用特点:
不受序列方向的影响,
能远距离发挥作用,
并可对异源基因的表达起作用。;1.4 转座子;一组受到共同调控的基因,都有一个相同的元件(序列),此元件能与某一个(类)专一蛋白因子结合,使基因对其作出反应。;;; 2 反式作用因子(trans-acting factors)
反式作用因子:通过扩散自身表达产物(酶、调节蛋白)控制其他基因的表达,其编码基因与其识别或结合的靶序列不在同一个DNA分子上。
包括:转录因子、RNA聚合酶、调控蛋白等。
2.1 反式作用因子的分类
2.2 反式作用因子的调控作用;2.1 反式作用因子的分类:
(1)??通用因子,在一般细胞中普遍存在,
;(3) 诱导型因子:和效应元件(特异调控序列)结合的蛋白因子。;蛋白质和DNA相互作用;
蛋白质和配基结合;
蛋白质之间的相互作用;
蛋白质的修饰。;DNA结合域,binding domain,BD:100aa, 大沟
转录激活域,active domain,AD:30-100aa;(1) 转录激活域;(2) DNA结合域的结构花式/基元( motif);① 锌指(zinc finger)
由一小组保守的氨基酸和锌离子结合,形???了相对独立的功能域,像一根根手指伸向DNA的大沟。
有两种基本构型;
;
~23aa,两指间7-8aa
共有序列: Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-
X5-Leu-X2-His-X3-His
串联重复排列,
锌指数目多少不等;SP1;;B. Cys2/Cys2;表 Cys2/Cys2型的作用因子;糖皮质激素特异性;(2) DNA结合域的结构花式/基元( motif);② 螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH)
至少有两个α螺旋,其间由短肽段形成的β转角连接,
二聚体形式存在,
距离正好相当于DNA一个螺距(3.4nm),两个α螺旋刚好分别嵌入DNA的深沟。
;许多调控蛋白都有HTH;(2) DNA结合域的结构花式/基元( motif);编码60aa的序列,几乎存在于所有真核生物中;
有3个?-helix,
H1与H2平行
H3位于大沟中,与DNA特异结合
N端多余臂部分与小沟结合,稳定性高。; HD与HTH的不同:
(1)HD的C端由3个α-螺旋构成,螺旋3结合于大沟;
而HTH至少2个α-螺旋构成;
(2)HD以单体形式与DNA结合,靶序列不是回文结构,
而HTH以二聚体形式与DNA结合,靶序列是回文结构。 ;(2) DNA结合域的结构花式/基元( motif);④螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH);;ZIP motif Y形结构;2.2 反式作用因子的调控方式(1) 蛋白质和DNA相互作用; ;2.2 反式作用因子的调控方式;(2) 蛋白质和配基的结合
有的调节蛋白并不直接与DNA接触,而先和配基结合被活化,如甾类受体蛋白等。
;;甾类受体蛋白通常有三个功能区;2.2 反式作用因子的调控方式;(3) 蛋白质之间的相互作用;第一节 概述
第二节 转录水平的调控
第三节 转录后加工水平的调控
第四节 翻译的调控;1 rRNA和tRNA的加工:剪切和修饰
2 mRNA加工成熟:
;真核tRNA的加工:
① 剪切、修剪和剪接;
② 甲基修饰;
③ 3’-OH连接-CCA结构。
④ 剪接内含子;
;1 rRNA和tRNA的
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