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; 单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells--PBMC)
是血液中含未分叶核的细胞,包括淋巴细胞和单核细胞;;
抑制RNA酶活性的试剂
焦磷酸二乙酯(DEPC):一种强烈的烷化剂,能够和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而以抑制外源RNA酶
异硫氰酸胍:一种强蛋白变性剂,可使包括RNA酶在内的所有酶活性丧失,抑制外源性RNA酶活性
;
1、外周血单个核细胞的分离
1)吸取2ml淋巴细胞分离液加入玻璃试管,待用
2)取抗凝血1ml,用1ml生理盐水混匀,然后沿管壁缓慢加入淋巴分离液上层 ,小心放入离心机,室温,离心2000rpm,15min
3)用塑料吸管吸去最上层的血浆,再吸取单个核细胞层于一新的离心管中,加生理盐水5ml
(至管口1cm),混匀后离心,2500rpm,8min
4)去上清,再次加生理盐水0.5ml,转入1.5ml的Ep管,2000rpm, 5min
5)留细胞沉淀于Ep管用于下一步的总RNA提取
;
2、单个核细胞中总RNA的提取纯化:trizol-氯仿一步法
1)在留有细胞沉淀的Ep管中一次加入500ul变性液trizol(吹打混匀)、100ul氯仿,置于漩涡混合器上混匀,冰浴15min
2)4℃12000rpm,离心15min,吸取上层水相转入Ep 管中,加等体积的异丙醇,-20℃,20min
3) 4℃12000rpm,离心15min,去上层异丙醇,加入500ul 70%乙醇进行洗涤。4℃12000rpm,5min,倒去70%乙醇,留沉淀烘干。
4)用10ul DEPC处理水溶解RNA,-20℃保存,用于逆转录
;
3、逆转录-- RT-PCR
1)反应体系:
25mM MgSO4 2ul
样品总RNA 1.25ul
随机引物 0.5ul
dNTP(各10mmol/L) 0.5ul
2?beast Buffer 5ul
Rnasin (20-40U/ul) 0.25ul
DEPC处理水 补至 10ul
注:体系已配好,直接加入样品总RNA ;3、逆转录-- RT-PCR ;1、去除外源RNase的干扰:操作要戴口罩,仪器用具要用0.1%DEPC水处理后灭菌;
2、PBMC提取时,加入抗凝血,并且注意加入血液的方式,离心时试管要轻拿轻放;
3、吸取单个核细胞时要注意不要吸取其它液层;2)琼脂糖凝胶电泳:
agrose gel电泳是分离鉴定和纯化DNA分子的常用方法,不同浓度的琼脂糖胶可分离100bp-60kb的DNA片段,在琼脂糖电泳中,DNA迁移的速率不仅与其分子量的对数值成反比,即分子量越大,移动速???越慢,而且还与分子构型有关如质粒开环DNA线性DNA共价闭合环状DNA
溴化乙锭(EB)能够嵌入
到DNA分子的碱基对中形成荧
光复合物,在紫外线激发下发
射荧光
; 二、 实验原理3)T4DNA连接酶: DNA连接酶是一种封闭DNA链上的缺口的酶,借助于ATP或 NAD+水解提供的能量,催化DNA的3’-OH与5’的磷酸基团生成磷酸二酯健。 T4DNA连接酶则连接双链DNA分子的粘性末端或平端。; 二、 实验原理3)TA克隆:利用Taq酶在延伸过程中会在DNA的末端加A的特性,使PCR扩增产物和带T尾的载体在连接酶的作用下连接起来。;三、实验步骤;实验步骤;三、实验步骤;实验步骤;四、注意事项;;;;;32;33;34;35;;;; 碱裂解提取质粒原理:主要利用宿主染色体DNA与质粒DNA之间的结构和大小的差异进行分离提取的。;;;43;质粒DNA小量提取:
一、收获
1)在含相应抗生素(Amp)的LB中接入一单菌落,于37℃剧 烈振摇下培养过夜。
2)将1.5ml培养物倒入Ep管中,室温 8000rpm离心30s,收集菌体
3)弃上清,将EP管倒置在吸水纸上,吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥;二、碱裂解
4)加100μl用冰预冷的溶液I(GTE缓冲液)中,旋涡振荡器剧烈振荡 5min。须确使细菌沉淀在溶液I中完全分散。
5)加200μl新配制的溶液Ⅱ(NaOH-SDS)。盖紧管口,快速颠倒Ep管5-10次以混合内容物。不要振荡,将Ep管放置于冰上5min。
6)加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ(乙酸钾溶液)。盖紧管口,
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