二十五章基因结构分析的基本策略教学培训.pptVIP

1）羟自由基足迹法 （Hydroxyl radical footprinting） 化学试剂 羟自由基 利用化学试剂产生的羟自由基攻击DNA分子表面脱氧核糖骨架使DNA断裂 当DNA结合蛋白将脱氧核糖遮盖时，自由羟基无法攻击而使这个区域的DNA受到保护 电泳图谱上出现空白区的地方就是结合蛋白质的DNA 变性凝胶电泳 2）体内基足迹法 （In vivo footprinting） 用化学试剂对活细胞进行体内处理，使DNA在细胞内受到化学修饰，然后裂解细胞，用化学法或酶法进行足迹实验。 甲基化干扰实验 (Methylation interference assay) 是利用化学试剂如硫酸二甲酯（Dimethyl sulfate, DMS）对活细胞DNA进行甲基化修饰，从而干扰蛋白质与DNA的结合。 乙基化干扰实验 (Ethylation interference assay) 是利用化学试剂对活细胞DNA进行乙基化修饰，从而干扰蛋白质与DNA的结合。 比较两个序列之间的相似性： 以上仅简介了NCBI相关数据库及工具软件关于其他数据库及软件工具等信息见书中第二十五章表1-5。 第二节 基因转录起始点的鉴定 主要内容： 一、基因转录起始点的序列特征 二、基因转录起始点的序列分析 一、基因转录起始点的序列特征 TATA bo