第一章核酸的结构与性质..pdfVIP

第一章：核酸的结构与性质 核 酸 分 为 两 类 ：核 糖 核 酸 （ribonucleic acid, RNA ）和 脱 氧 核 糖 核 酸 （deoxyribonucleic acid, DNA ）。前者是核苷酸的聚合物， 后者是脱氧核苷酸的聚 合物。 第一节 DNA 的结构 一、 DNA 的化学组成 DNA 的组成单位是脱氧核苷酸（ deoxynucleotide）。脱氧核苷酸有三个组成 成分：一个磷酸基团 (phosphate)，一个 2 ’-脱氧核糖（ 2 ’-deoxyribose）和一个碱 基 (base)。 1、碱基 构成 DNA 的碱基可以分为两类，嘌呤（ purine）和嘧啶（pyrimidine ）。嘌呤 为双环结构 (Bicyclic) ，包括腺嘌呤 (adenine)和鸟嘌呤 (guanine)，这两种嘌呤有着 相同的基本结构，只是附着的基团不同。而嘧啶为单环结构 (monocyclic) ，包括 胞嘧啶 (cytosine)和胸腺嘧啶 (thymine)，它们同样有着相同的基本结构。 2、脱氧核苷 嘌呤的 N9 和嘧啶的 N1 通过糖苷键与脱氧核糖结合形成 4 种脱氧核苷 （deoxynucleoside），分别称为 2’－脱氧腺苷， 2’－脱氧胸苷， 2 ’－脱氧鸟苷和 2’ －脱氧胞苷。 3、脱氧核苷酸 脱氧核苷酸由脱氧核苷和磷酸组成。 磷酸与脱氧核苷 5’－碳原子上的羟基缩 水成 5’－脱氧核苷酸。脱氧核苷单磷酸依次以磷酸二酯键相连形成多核苷酸链 (polynucleotide)，即一个核苷酸的 2’－脱氧核糖上的 3 ’－羟基与另一核苷酸上的 5 ’－磷酸基形成磷酸二酯键 (phosphodiester group) 。多核苷酸链以磷酸二酯键为 基础构成了规则的不断重复的糖－磷酸骨架，这是 DNA 结构的一个特点。核苷 酸的一个末端有一个游离的 5’基团，另一端的核苷酸有一游离的 3 ’基团。人们 习惯于从 3 ’→5 ’方向书写核苷酸系列，即从左侧的 5 ’端到右侧的 3 ’端书写。 二、 DNA 双螺旋 根据这一模型，双螺旋的两条反向平行的多核苷酸链绕同一中心轴相缠绕， 形成右手螺旋， 一条是 5’→3 ’，另一条 3 ’→5 ’。磷酸与脱氧核糖彼此通过 3 ’、5 ’- 1 磷酸二酯键相连接，构成 DNA 分子的骨架。磷酸与脱氧核糖在双螺旋外侧，嘌 呤与嘧啶碱位于双螺旋的内侧。碱基平面与纵轴垂直 (perpendicular to the helix axis)，糖环平面与纵轴平行。 两条核苷酸链之间依靠碱基间的氢链结合在一起，形成碱基对。位于两条 DNA 单链之间的碱基配对是高度特异的：腺嘌呤只与胸腺嘧啶配对，而鸟嘌呤 只 与 胞 嘧 啶 配 对 ， 结 果 是 双 螺 旋 的 两 条 链 的 碱 基 序 列 有 互 补 关 系 (complementary)，其中任何一条链的序列都严格决定了其对应链的序列。 碱基对 杂环之间的相互作用称为碱基堆积（ base stacking），可增加双螺旋的稳定性。 氢键对于碱基配对的特异性也非常重要。 设想我们试着使腺嘌呤和胞嘧啶配 对，这样一个氢键受体（腺嘌呤的 N1）对着另一氢键受体（胞嘧啶的 N3）。同 样，两个氢键供体，腺嘌呤的 C6