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动物血红蛋白结构分析
1、研究进展
脊椎动物 hemoglobin (Hb)蛋白有 4 个亚基构成,为 α2 β2结构,每个亚
基均有 1 条多肽链和具有 1 个亚铁离子的血红素分子构成, 含有 1 个血红素基团
和 1 个氧结合部位, 形成珠蛋白,结合 4 个血红素基团之后变形成了血红蛋白 [1] 。
当血红蛋白与氧结合时,形成氧合血红蛋白,从而使得血液呈鲜红色 [2] 。
血红蛋白的载氧功能与其亚基结构的 2 种状态有关,在缺氧组织 ( 如肌肉组
织 ) 中,亚基处于紧张状态 (T 状态 ) ,使氧不能与血红素结合,所以在需氧组织
里可以快速地脱下氧, 将氧气释放, 而在含氧丰富的肺或鳃中, 亚基结构呈松弛
状态 (R 状态 ) ,使氧极易与血红素结合,从而迅速地结合氧气,将氧运载至需氧
组织 [1] 。
人血红蛋白自身可以产生 NO,可以帮助把氧气输送到各种人体组织, 起到扩
张血管和稳定血压的作用 [3] 。血红蛋白可以维持机体内环境的酸碱稳定,具有波
尔效应 [1] 。人血红蛋白的研究在疾病方面也较多:如利用血红蛋白可以作为检测
一些疾病的指标等。 啮齿类动物等的脑血红蛋白行使贮存氧气的功能, 以保证当
氧气供应不足时,大脑的氧气浓度的暂时恒定 [4] 。
2、立体依据
动物血红蛋白不仅具有运载氧气的功能,还具有氧化酶活性、过氧化物酶活
性和抗菌等功能。 动物血红蛋白功能及结构千差万别, 尤其是无脊椎动物, 保守
性较低 . 但是其主要功能——氧运载蛋白功能没有改变;由于血红蛋白的某些结
构的变化, 从而可以使得血红蛋白获得新的功能。 研究动物血红蛋白的结构对揭
示生物进化具有重要意义 [5] 。
3、研究内容
对血红蛋白进行基本性质分析、亚细胞定位分析、跨膜性质分析、二级结构
预测、三级结构预测等。
4 、研究方案
血红蛋白序列的获得
进入 BCBI主页选择 protein 搜索 hemoglobin ,以 fasta 格式保存。
基本性质分析
4.2.1 进入网址:;
4.2.2 选择 Primary structure anaslysis 的 ProtParam 程序;
4.2.3 在对话框中输入血红蛋白原序列,点击分析;
4.2.4 记录结果并分析。
亚细胞定位
4.3.1 进入 PSORT主页:;
4.3.2 将血红蛋白原序列输入对话框,点击分析;
4.3.3 记录结果并分析。
跨膜性质预测
4.4.1 进入网址:;
4.4.2 在对话框中输入血红蛋白原序列,点击分析;
4.4.3 记录结果并分析。
二级结构分析
4.5.1 进入 JPred 主页,点击 Email 结果提交方式,输入血红蛋白原序列;
4.5.2 设置各项参数,点击 Run提交;
4.5.3 在邮箱中找到结构地址,进行查看;
4.5.4 记录结果并分析。
三级结构分析
4.6.1 进入 SWISS-MODLE三级结构预测服务器;
4.6.2 填写 Email 地址,选择 First Approach mode
4.6.3 在 Result option 选择 Awiss-Pdb Viewer mode ;
4.6.4 提交序列;
4.6.5 将邮箱中返回的 PDB文件用 rasmol 软件浏览,用 Awiss-Pdb Viewer 软
件进行简单分析。
5、结果分析与评价
血红蛋白序列
gi|160797|gb|| hemog
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