核酸的鉴定与保存.pptxVIP

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1; 核酸的结构与功能是分子水平生命活动的基础; 内源基因的突变、表达及调控的异常和外源致病基因的侵入是人类疾病发生、发展的根源。; DNA、RNA是生物体中最重要的核酸分子,是分子生物学和分子诊断的研究对象。 DNA、RNA的分离纯化是分子生物学研究及对疾病进行分子诊断的最基础工作。;核酸分离纯化的原则   一、 保持核酸一级结构的完整性   二 、尽可能提高核酸制品的纯度;提取DNA总的原则 ;第一节 核酸分离纯化的设计及原则;第一节 核酸分离纯化的设计及原则 ;一、材料与方法的选择;一、材料与方法的选择;(一) 材料与方法的选择; 1、保持核酸碱基序列的完整性 2、尽量清除其它分子的污染,保证核酸纯度 3、保持核酸的完整性 应尽量简化分离纯化步骤,缩短提取时间 尽量避免各种有害因素对核酸的破坏 ;二、技术路线的设计;(一)核酸的释放;表5-1 各种组织细胞破碎方法;核酸分子抽提的技术设计;;; 应该清除的杂质主要包括三部分 1、非核酸的大分子污染物:蛋白质、多糖及脂类 物质等 2、非需要的核酸分子:分离某一特定的核酸分子 时,其它的核酸分子皆为杂质 3、加入的有机溶剂和某些金属离子;(三)核酸的浓缩、沉淀与洗涤;三、核酸的鉴定与保存;(一)核酸的鉴定; ⑴ 紫外分光光度法:该法是基于核酸分子 中的碱基具有共轭双键结构因而可以吸收 紫外线,其最大吸收波长为260nm。 ; 各种碱基的紫外吸收光谱; ⑵ 荧光光度法:核酸的荧光染料溴化乙锭嵌 入碱基平面后,本身无荧光的核酸在UV激 发下发出红色荧光,且荧光强度的积分与 溶液中核酸的含量呈正比。 ;EB与DNA的结合 ; ⑴ 紫外分光光度法:该法主要通过A260与A280 的比值来判定有无蛋白质的污染,比值升高与 降低均提示不纯。 在TE缓冲液中,纯DNA的A260/A280为 纯RNA的A260/A280比值为;1. DNA或RNA的定量 OD260相当于 50μg/ml双链DNA 40μg/ml单链DNA(或RNA) 20μg/ml寡核苷酸 2.判断核酸样品的纯度 DNA纯品: OD260/OD280 RNA纯品: OD260/OD280 ;浓度鉴定; ⑵荧光光度法:用EB等荧光染料示踪的核酸电 泳结果可判定核酸制品的纯度。DNA分子较 RNA大得多,电泳迁移率低。;;⑴ 琼脂糖凝胶电泳法:   以EB为示踪剂的核酸凝胶电泳结果可 判定核酸制品的完整性。基因组DNA片段 的分子量很大,在电场中泳动很慢,如果 发生降解,电泳图呈拖尾状。;DNA片段的降解;完整或降解很少的总RNA电泳图谱中,三条带荧光强度积分应呈特定的比值,沉降系数大的核酸区带,电泳迁移低,荧光强度积分高;反之,分子量小,电泳迁移率高,荧光强度积分低。 ; 一般而言,28S(23S)RNA的荧光强度约为18S(16S)RNA的2倍,否则提示有RNA的降解。若 在点样孔附近有着色条带,则说明存在DNA 的污染。 ; 总RNA电泳图谱;;(二)核酸的保存 ;1、短期贮存: 4℃或-20℃存放于TE(tris和EDTA)缓冲液中。 TE缓冲液的PH与DNA 贮存有关,PH为8时,可减少DNA脱氨反应,PH低于时DNA容易变性。 2、长期贮存: TE缓冲液中-70℃保存数年;在DNA溶液中加一滴氯仿可有效防止细菌和核酸的污染。;2、RNA的储存;第二节 真核基因组DNA的分离纯化 ;生物体组织细胞;第二节 真核基因组DNA的分离纯化;DNA酚抽提法示意图; 一、酚抽提法;;DNA样品准备;;;;;为什么苯酚要重蒸饱和后才能用于DNA的分离?;DNA的沉淀;DNA的浓缩 ; DNA的检测 ;二、甲酰胺解聚法;; 三、玻棒缠绕法;;四、其它方法;五、 DNA片段的纯化;;六、 DNA片段的回收;六、 DNA片段的回收;1.二乙基氨基乙基-纤维素膜插片电泳法 2.电泳洗脱法 3.冷冻挤压法 4.低熔点琼脂糖凝胶挖块回收法;;;;;;(二) 从聚丙烯酰胺凝胶回收DNA片段;至今尚无一种方法既能有效回收DNA大片段或微量的DNA片段,又能同时回收几种DNA片段并有效清除凝胶中酶促反应抑制剂。;第三节 质粒DNA的提取与纯化 ;质粒简介 ;;;;质粒特性 ;常用质粒载体 ;; pUC系统 ;;质粒DNA的提取和纯化 ;;;2.细菌的收集与裂解 ;;;质粒DNA提取方

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