分子力学基本原理.pptVIP

微观尺度材料设计?? 分子力学 分子结构的优化 首先，给出所计算分子的试探结构。不一定是分子的稳定构象，而且往往不是稳定构象。 然后，将总空间能Es对所有描述分子构象的变量即分子各原子的三维坐标在一定的范围内求极小值。 由于数学上只能保证求得局部极小值，即实现局部优化，而不一定能求得全局最小值。所以得到的是在这一构象附近的一相对稳定的构象。 分子力学常用的优化方法有使用一阶导数的最速下降法和使用二阶导数的Newton-Raphson法。 第三十一页，共46页 微观尺度材料设计?? 分子力学 分子结构的优化 粗结构 能量极小构象 分子几何优化 E 局部极小值问题；鞍点 第三十二页，共46页 微观尺度材料设计?? 分子力学 分子结构的优化 用于描述分子初始结构的原子坐标可以使用分子内坐标、直角坐标或晶体坐标。从晶体数据得到初始结构数据往往是比较方便的，若没有晶体数据，则可用Dreiding模型来估计。 输入坐标及连接关系 力场选择、作用项、参数 能量极小化 最终结构与能量 其它信息 第三十三页，共46页 分子力学基本原理 第一页，共46页 微观尺度材料设计?? 分子力学 分子力学，又叫力场方法（force field method），目前广泛地用于计算分子的构象和能量。 分子力学从本质上说上是能量最小值方法，即在原子间相互作用势的作用下, 通过改变粒子分布的几何位型, 以