affymetrix表达谱芯片在医学基础研究中的应用.pptVIP

Affymetrix表达谱芯片在医学基础研究中的应用;目录;;The Genomics Time Line;Moving GeneChip? to the ClinicAffymetrix致力于将技术应用于临床;;Affymetrix系统及芯片 生产已经取得ISO国际认证;在欧洲取得进入临床 许可;美国食品和药品监督局（FDA）已经审批经过了Affymetrix GeneChip? System 3000Dx (GCS 3000Dx)——一个用于分析体外诊疗（IVD）芯片 仪器系统 ;Introduction: What GeneChip Can Do? Affymetrix芯片技术囊括基因组转录组水平 研究热点;Central Annotation;;;基因芯片化学原理;;Harnessing the Power of Photolithography;光蚀刻原位合成生产工艺是高质量芯片 基础;;Affymetrix荧光标识系统——信号级联放大原理;表示谱芯片试验步骤;表示谱试验步骤;表示谱芯片应用;;表示谱基因芯片关键品质;GeneChip Expression Array Design ;Expression Catalog Products;What has been done? ;SLE病人滑膜组织特异性表示谱biomarker 筛选;使用表示谱技术筛选出SLE病人IFN因子调控相关基因做为疾病判定与诊疗效果 biomarker;表示谱可用于登革热疾病发展估计;建立表示谱水平肝细胞肝癌预后标志物以指导诊疗方案;表示谱试验设计思绪;表示谱试验成功对样本 几点要求;表示谱芯片数据分析步骤;Omniviz -Unsupervised Analysis -identified 16 groups ;经过对45 control, 36 patients not be detected by (MRI); 137 patients MRI detected such lesions 表示谱分析发觉, 两组病人间表示谱有很显著 差异和规律性, 从中确定出最有差异性 57个基因, 在这57个基因中依据疾病 特点, 造骨细胞能力下降, 破骨细胞能力增高, 选出最相关 4个基因, 再辅以功效验证, 确证DKK1这个分泌因子 关键骨髓瘤相关作用。;Results: 经过对5个二型糖尿病胰岛, 7个正常人胰岛 比较分析, 找到243个上调基因, 137个下调基因, 依据胰岛素分泌不足 思绪, 专门关注了137个下调 基因, 并发觉转录因子ARNT显著低表示, 再辅以RNAi和基因敲除技术分别证实ARNT 不表示能够造成糖尿病相关 表型及分子机制.?这项研究代表了DNA芯片在研究糖尿病病人胰岛 首次成功应用;表示谱技术利用于复杂 免疫网络调控事件;Positive regulation of immune cell function and inflammatory responses by phosphatase PAC-1. Nat Immunol, Mar ; 7(3): 274-83. 经过表示谱判定了人白细胞中被诱导 最高表示水平 基因之一: DUSP2, 该基因编码磷酸酶PAC-1, 是参与免疫细胞激活 关键组员。 Systems biology approaches identify ATF3 as a negative regulator of Toll-like receptor 4. Nature, May ; 441(7090): 173-8. 经过Toll-like receptor (TLR)激活巨噬细胞, 判定出一组基因,且找到该组基因受activating transcription factor 3 (ATF3)调控,而ATF3是CREB/ATF转录因子家族组员之一, 本文第一次找出ATF3与免疫反应调整 关系. Restoring function in exhausted CD8 T cells during chronic viral infection. Nature, Feb ; 439(7077): 682-7. 经过基因表示谱芯片技术判定了T细胞功效紊乱(T-cell dysfunction)相关 一个关键基因PD-1.作者比较了耗竭 (exhausted)与有功效 LCMV特异 CD8 T细胞( LCMV-specific CD8 T cells)基因表示 差异,