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影响Tm值的因素 (3)溶液的性质 (2)DNA的性质和组成 大肠杆菌DNA在不同浓度KCl溶液下的熔融温度曲线 (1) DNA的均一性 RNA的变性 变性曲线不那么陡, Tm值较低。 复性 变性DNA在适当条件下,两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。 核酸的杂交(hybridization) 三、DNA的三级结构 DNA的三级结构指DNA分子通过扭曲和折叠所形成的特定构象。 超螺旋(superhelix)是DNA三级结构中最常见的形式。 正超螺旋:3.4nm间距内碱基对数多于10个。 负超螺旋:3.4nm间距内碱基对数少于10个。 √ 第三节 RNA的分子结构 动物、植物和微生物细胞内都含有三种主要RNA: 核糖体RNA(ribosomel RNA, rRNA); 转运RNA(transfer RNA, tRNA); 信使RNA(messenger RNA, mRNA)。 RNA的种类及结构 一、tRNA 约占总RNA的10-15%。 tRNA分子的大小很相似,分子量25000左右,链长一般在73-93个核苷酸之间。 tRNA结构特点 碱基组成中含有较多的稀有碱基。 3 ′-末端都具有-CCA-OH的结构。 5 ′端多为G,也有C。 tRNA的二级结构都成三叶草型。三叶草结构由氨基酸臂、二氢尿嘧啶环、反密码环、额外环和TψC环五个部分组成。 假尿嘧啶核苷 双氢尿嘧啶 在三叶草型二级结构的基础上,突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对,目前已知的tRNA的三级结构均为倒L形。 二、mRNA 约占总RNA的5%。 不同细胞的mRNA的链长和分子量差异很大。 它的功能是将DNA的遗传信息传递到蛋白质,指导蛋白质的合成。 mRNA的结构特点 真核生物mRNA的结构特点 5′末端形成帽子结构:m7Gppp; 3′末端多聚A尾。 真核 单顺反子 5-末端有“帽子” 3‘-末端有polyA片段(~200)和非编码区 原核 多顺反子 5‘-末端无“帽子” 3‘-末端无polyA片段 顺反子: mRNA上具有翻译功能的核苷酸顺序。 抗核酸酶的水解 与蛋白质合成起始有关 作为mRNA与核糖体40S亚基结合的信号。 “帽子”结构的功能 三、rRNA rRNA含量很大,约占细胞RNA总量的80%左右。 是核糖核蛋白体的主要组成部分。 rRNA 的功能与蛋白质生物合成相关,可分别与 mRNA、tRNA作用,催化肽键的形成。 原核生物中的rRNA有三种:5S,16S,23S。 真核生物中的rRNA有四种:5S,5.8S,18S,28S。 四、RNA的高级结构特点 RNA是单链分子,分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。 形成“发夹型”结构或茎环结构。 tRNA中除了常见的碱基外,还存在一些稀有碱基。 第五节 核酸的性质及其分离纯化 一、核酸的一般物理性质 DNA:白色纤维状固体;RNA:白色粉末状固体。均微溶于水,不溶于有机溶剂。 核酸含有磷酸基团,因此具有酸性;水溶液中带负电荷,电泳时向正极迁移。 DNA溶液粘度很大,RNA溶液粘度小的多。 核酸受到强大离心力的作用时,可从溶液中沉降下来,其沉降速度与核酸的大小和密度有关。 (了解) 核酸的紫外吸收 核酸的最大吸收值在260nm附近。 紫外吸收是实验室中最常用的定量测定DNA或RNA的方法。 核酸纯度判定:OD260/OD280 纯DNA:1.8;纯RNA:2.0 OD260=1.0相当于50μg/ml双链DNA或40μg/ml单链 DNA(或RNA) or 20μg/ml 寡核苷酸。 A=ε·C·L朗伯-比尔定律 (Lambert-Beer Law) ε:摩尔消光系数,C:样品浓度;L:光程;A:吸收值 ε:DNA(~6000),RNA(7700-7800) (了解) 核酸的变性、复性和杂交 变性(denaturation) 在理化因素作用下,DNA双螺旋区的氢键断裂,两条互补链分开成为单链,从而导致DNA的理化性质及生物学性质发生改变,这种现象称为DNA的变性。 变性是核酸双螺旋区的氢键断裂,变成单链,不涉及共价键的断裂。 多核苷酸骨架上共价键(3’,5’-磷酸二酯键)的断裂称为核酸的降解。 DNA的变性 方法:过量酸,碱
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