真核生物基因结构的预测分析.pptVIP

关于真核生物基因结构的预测分析 第1页，共37页，编辑于2022年，星期五 * 基因组序列cDNA序列 编码区预测 Codon bias GC Content 限制性酶切位点 基因结构分析 选择性剪切 转录调控因子 序列比对 功能注释 KEGG GO 系统发育树 蛋白质序列 翻译 蛋白质理化性质 二级结构预测 结构域分析 重要信号位点分析 三级结构预测 基因组功能分析 第2页，共37页，编辑于2022年，星期五 * 真核生物基因的主要结构 第3页，共37页，编辑于2022年，星期五 * 基因结构分析 开放读码框 GENSCAN CpG岛 CpGPlot 转录终止信号 POLYAH 启动子/转录起始位点 PromoterScan 密码子偏好分析 CodonW mRNA剪切位点 NETGENE2 Spidey 选择性剪切 ASTD 基因结构分析常用软件 第4页，共37页，编辑于2022年，星期五 * 开放读码框的识别 开放读码框（open reading frame, ORF) 是一段起始密码子和终止密码子之间的碱基序列 ORF 是潜在的蛋白质编码区 第5页，共37页，编辑于2022年，星期五 * 基因开放阅读框/基因结构分析识别工具 ORF Finder /gorf/gorf.html NCBI 通用 BestORF /berry.phtml?topic=bestorfg