《生物数据可视化技术》教学大纲（本科）.docxVIP

PAGE PAGE 131 生物数据可视化技术 一、课程简介 生物数据可视化技术件课程主要运用计算机语言将生物医学数据以及分析结果进行图形学和图像处理技术，将数据换为图形或图像在屏幕上显示出来，并进行交互处理的理论、方法和技术。它涉及到计算机图形学、图像处理、计算机辅助设计、计算机视觉及人机交互技术等多个领域。 通过本课程的学习，使学生能够较熟练掌握基本图形生成算法、及图形变换，熟悉相关软件，并能够将生物数据可视化，提高解决实际问题的基本能力。 二、理论教学内容 R语言绘图界面和图形参数简介 掌握内容：R语言绘图界面分为三部分以及每一部分所控制的区域；掌握基本图形参数，包括符号和线条，颜色，图形尺寸与边界尺寸等。 了解内容：文本属性。 散点图、线图、条形图、饼图、热图 掌握内容：熟练掌握plot（），points（），lines（）等基本绘图函数及每个函数中对应的参数：curve（），segments（），polygon（）等绘图函数。 了解内容：qqnorm创建QQ图。 坐标、文本 掌握内容：掌握axis（），text（），mtext（），title（），legend（）函数等文本操作函数及相应的参数。 了解内容：图形的存储和导出。 网络绘制 掌握内容：通过导入igraph包，挖掘和绘制网络信息。了解内容：如何使用igraph来实现简单的图表算法。 5.复合图形 掌握内容：par（）函数的灵活运用以及相应的参数；将之前的简单图形进行组合，生成新的复合图形。 了解内容：调控界面比例参数。 三、实验教学内容 遗传算法的算法实现 基本内容：遗传算法的基本流程框架，并应用举例。 基本要求：算法实现遗传算法的遗传操作，并给出简单举例的算法流程。 蚁群优化算法的算法实现 基本内容：蚁群优化算法的基本流程框架，并应用举例。 基本要求：算法实现蚁群优化算法的信息素更新与路径构建，并给出简单举例的算法流程。 四、参考资料 参考书 《计算智能》.张军.清华大学出版社.2009 《现代智能优化：混合算法及其应用》.梁旭.电子工业出版社.2011 《智能优化算法原理与应用》.李士勇.哈尔滨工业大学出版社.2012 《R数据可视化手册》第一版.Winston Chang主编.人民邮电出版社.2014年5月出版 《大数据可视化技术》第一版.周苏主编.清华大学出版社.2016年11月出版 网络资源 数据可视化（ /qingqing7/article/details R语言之数据可视化（https:// /learn/640） 五、学时分配 序号 教学内容 参考学时 总学时 理论学时 实验学时 1 R 语言绘图界面和图形参数简介 6 2 4 2 散点图、线图、条形图、饼图、热图、散点图、线图 14 2 12 3 坐标、文本 6 2 4 4 网络绘制 10 2 8 5 复合图形 6 2 4 合计 42 10 32