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PCR技术及其应用;目 录; 多聚酶链式反应
(PCR:Polymerase Chain Reaction);体内DNA的复制体系;Mullis的PCR构思;Taq DNA聚合酶(thermus aquaticus);PCR反应循环;;;1)PCR反应成分;(2)引物浓度
0.1-0.5 ?mol/L
浓度过高易导致模板与引物错配,反应特异性下降。
(3)Taq DNA聚合酶
0.5-2.5 U/50 ?l
酶量增加使反应特异性下降;酶量过少影响反应产量。;(4)dNTP
dNTP浓度取决于扩增片段的长度
四种dNTP浓度应相等
浓度过高易产生错误碱基的掺入,浓度过低则降低反应产量
dNTP可与Mg2+结合,使游离的Mg2+浓度下降,影响DNA聚合酶的活性。;(5) Mg2+;2)循环参数
变性
使双链DNA解链为单链
94℃, 20-30秒
(2) 退火
温度由引物长度和GC含量决定。
增加温度能减少引物与模板的非特异性结合;降低温度可增加反应的灵敏性。
;(3)延伸
70-75℃,一般为72℃
延伸时间由扩增片段长度决定
(4)循环次数
主要取决于模版DNA的浓度
一般为25-35次
次数过多:扩增效率降低
错误掺入率增加;PCR技术的特点;2)特异性;引物设计:
(1)序列应位于高度保守区,与非扩增区无同源
序列。
(2)引物长度以15-40 bp为宜。
(3)碱基尽可能随机分布,G+C占40-60%。
(4)引物内部避免形成二级结构。
(5)两引物间避免有互补序列。
(6)引物3’端为关键碱基;5’端无严格限制。;3)操作简便易行;RT-PCR; 实时荧光定量PCR仪;PCR示例;1、材料:含1Kb插入片段的克隆载体Pmd18-T
质粒DNA
2、仪器:微量移液器及吸头、PCR仪及PCR管
琼脂糖凝胶电泳设备
3、试剂:10XPCR 反应缓冲液
25mmol/L MgCl2
10mmol/L dNTP
10μmol/L 引物1和引物2;1.按照如下体积向PCR管中按顺序加入各试剂
并混匀:
10 X PCR反应缓冲液 2.5 μL
25mmol/L MgCl2 2.0μL
10mmol/L dNTP 1.0 μL
10μmol/L 引物1 1.0 μL
10μmol/L引物2 1.0μL
质粒DNA 1.0 μL
Taq 0.1 μL(5U)
水补充至 25.0 μL;2.按照如下体积向PCR管中按顺序加入各试剂
并混匀:
10 X PCR反应缓冲液 2.5 μL
25mmol/L MgCl2 2.0μL
10mmol/L dNTP 1.0 μL
10μmol/L 引物1 1.0 μL
10μmol/L引物2 1.0μL
质粒DNA 1.0 μL
Taq 0.1 μL(5U)
水补充至 25.0 μL;3.反应完成后,将反应液与凝胶电泳缓冲液按比例混匀,上样电泳。;The End!
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