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天河二号及其应用介绍杜云飞国防科大国家超级计算广州中心OUTLINE中心简介软件介绍应用介绍近期建设主要内容国家超级计算广州中心NATIONAL SUPERCOMPUTER CENTER IN GUANGZHOU一. 中心简介中心建设历程2014年4-6月2011年11月四方签署战略合作协议，联合申报“十二五”863项目“天河二号”一期系统研制成功，入驻国家超级计算广州中心大楼2013年6-10月中心正式对外提供服务，中心获科技部正式授牌。中心建设历程2015年9月广州市政府与中山大学签订《广州超算中心固定资产委托管理协议》2015年11月2016年6月天河二号HPCG排行榜五连冠天河二号TOP500实现六连冠 二期系统 计划达成100PF峰值计算速度、Linpack效率60%等目标“天河二号”国家“863”计划和“核高基”国家科技重大专项项目标志性成果“天河”新一代高性能计算机系统研制课题自主知识产权的突破亿亿次级高效能计算的计算机系统 建设目标峰值运算速度每秒十亿亿次（100PF）以上、全系统Linpack效率60%以上、系统能效比每瓦50亿次（5GF/W ）以上Top500六连冠 ( 2013.6~2016.6 ) HPCG 五连冠 ( 2014.6~ )系统概况双路 12 核 Intel Xeon E5-2692V2内存 64GB （部分128GB）3* Intel Xeon Phi 加速卡 (GPDSP , Matrix2000)定制的内部高速互联 TH2 Express-2+ 全局共享存储系统容量15PBCompute BladeCompute RackSystemCompute Frame天河二号技术特点异构多态体系结构自主定制互连网络层次式加速存储架构高效自治的软件栈高密度高精度结构工艺自主定制高速互连网络互连通信系统决定系统大规模扩展结点性能越高，通信要求越高系统规模越大，通信性能越重要天河二号高速支撑100PF系统自主网络协议胖树拓扑结构光电混合互连技术自适应互联架构Speedup of starccm+ ( GBE vs TH2 Express-2+ )二. 软件介绍适配软件适配软件分类软件名称软件功能特点数值天气预报/newsdetail.html?6169WRF天气预报海洋/newsdetail.html?6167WAVEWATCH III海洋,波浪模型海洋/newsdetail.html?6168FVCOM非结构网格,有限体积法,自由表面海洋/newsdetail.html?6171ELCIRC 海岸,有限体积,非结构网格大气环境/newsdetail.html?6173CMAQ 空气污染地球系统/newsdetail.html?6175CESM地球系统模拟,有限元宇宙/newsdetail.html?6170Cubep3mN-body, 大尺度适配软件软件名称软件功能特点OpenFOAMFVM方法CFD综合类Code-AsterFEM方法结构分析code-saturne FVM方法CFD传热传质palabosLBM方法,CFDFDS火灾模拟 ElmerFEM方法多物理场耦合拟采购商业软件：Ansys、LS-dyna、Abaqus、starccm+、hyperworks 软件布局OpenFOAMElmerMEEPMPB时间尺度宏观力学LAMMPSGROMACSDL_MESOms介观动力学LAMMPSDL_POLYNAMDGROMACSμs分子动力学nsQuantum\ ESPRESSOABINITOctopusps量子力学μmmm空间尺度nm?LAMMPSQuantum Espresso中等规模：Au表面：112 atoms, 2*2*1 k-mesh大规模：以porphyrins功能化的CNT：1532 atoms, 5232 electrons, Γ pointCray XT3(Ref) J. Phys.: Condens. Matter 21 (2009) 395502商业软件VASPGaussianMaterial StudioAmberCHARMMWien2k VASPNSFC-广东联合基金超级计算科学应用研究专项NSFC用户：600+；材料科学方向用户：177 ； VASP用户：78VASP 性能测试VASP 5.3.3：16 cores per nodeOpt. of ZnO: 288 O, 288 ZnSCF of ZnO: 288 O, 288 ZnQM/MMThe Nobel Prize in Chemistry 2013Martin Karplus, Michael Levitt, Arieh Warshelfor the development of multisca
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