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- 约 80页
- 2022-07-28 发布于天津
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2、锌指(zinc finger) Zn2+与4个Cys 、或2个Cys和2个His相结合。 整个蛋白质分子有2-9个锌指重复单位。 每一个单位的指部伸入DNA双螺旋的深沟,接触5个核苷酸。 (教材P.301-303) (1)I型锌指:2Cys / 2His ~23aa Cys- X2-4- Cys-X3-Phe- X5 -Leu- X2 -His- X3 -His Cys,His与Zn2+结合形成4面体结构,使中部的氨基酸回折成环,凸出如手指 中部芳香族氨基酸保守,疏水 串联重复排列,两指间7-8aa 锌指数目多少不等 与GC盒结合的转录因子SP1中有连续的3个锌指重复结构。 SP1 TF III A 344aa,N端与DNA结合 9个锌指,每个~30aa 与5s rRNA基因内启动子 (50bp)结合 (2)Ⅱ型锌指:4Cys 保守序列为: Cys- X2- Cys-X13-Cys- X2- Cys Zn2+与4个Cys结合 DNA结合序列较短,对称 无大量重复性锌指 Cys2/Cys2与 Cys2/His2不同 例如GAL4,酵母的转录因子,哺乳类的固醇类激素受体 糖皮质激素特异性 雌激素特异性 类固醇激素受体是以二聚体形式发挥其促进转录作用的。它们的两个锌指的功能不同。 第1个锌指的右侧是控制与DNA结合的,第2个锌指的左侧则是控制形成二聚体的能力的。 3、同源域(Homeodomain) 最早在果蝇的homeotic loci(决定身体结构)中发现同形异位现象(homeosis): 果蝇头部长触角部位长出脚来。 同形异位盒基因(homeobox) : 高度保守的一段核苷酸序列(180bp), 控制胚胎发育的基因。 从酵母到人类都存在; homeobox, DNA序列高度保守。 (教材P.304-305) Homeodomain 有3个?—helix, H1与H2平行 H2与H3形成HTH motif H3位于大沟中,与DNA特异结合 N末端位于小沟中,与DNA接触 HD与HTH的不同: (1)HD的C端由3个α-螺旋构成,螺旋3结合于大沟;而HTH至少2个α-螺旋构成; (2)HTH以二聚体形式与DNA结合,而HD是以单体形式与DNA结合。 -COOH,每隔6个氨基酸出现一个Leu,所有Leu出现在同一侧面,成直线排列,形成疏水面 依靠Leu的疏水作用,2个helix 相互缠绕,形成拉链结构 -NH2,富含碱性氨基酸,螺旋状,+,碱性DNA结合域, 与DNA双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合 4、碱性-亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP) (教材P.303-304) 5、碱性螺旋--环--螺旋(basic helix-loop-helix) 40~50aa 含2个?-helix(15~16aa), 由连接区(12~28aa)连接;两亲性, amphipathic;通过疏水面作用形成二聚体; -NH2端为碱性结合区,16aa,其中6aa为保守序列。 (教材P.304) 缺乏碱性区的蛋白质,即使形成(同、异)二聚体,也无法同DNA结合 (四)蛋白质和配体的结合 甾类受体蛋白有3个不同的功能区: (1)N-端区是激活转录所需的区域,不同受体之间此区的同一性仅小于15%; (2)DNA结合及转录活化区,同一性较高为94-42%; (3)C-端的激素结合和二聚体形成区,同一性为57-15%。? 糖皮质激素对转录的调控 激素-受体复合物进入细胞核,与增强子结合从而激活启动子,开始转录。 糖皮质激素进入细胞,与受体结合; (五)DNA结合蛋白主要转录激活结构域 转录激活结构域(transcription activation domains)一般由20-100个氨基酸残基组成。如GAL4分子中有2个这种结构域,分别位于多肽链的第147-196位和第768-881位;GCN4的转录激活结构域位于多肽链的第106-125位。 (教材P.305-306) 1、酸性α-螺旋(acidic α-helix)(A区) 该结构域含有由酸性氨基酸残基组成的保守序列,多呈带负电荷的亲脂性α-螺旋,包含这种结构域的转录因子有GAL4、GCN4、糖皮质激素受体和AP-1/Jun等。增加激活区的负电荷数能提高激活转录的水平。可能是通过非特异性的相互作用与转录起始复合物上的TFIID等因子结合生成稳定的转录复合物而促进转录。 2、谷氨酰胺丰富区(glutamine-rich domain)(P区) SP1的N末端含有2个主要的转录激活区,氨基酸组成中有25%的谷氨酰胺,很少有带电荷的氨基酸残基。酵母的HAP1、HAP2和GAL2及哺乳动
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