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队伍编号 21090130009
题号 B
基于群智能和机器学习的三维团簇稳态结构预测研究
摘 要
原子团簇是由数个至数千个原子相互作用形成的相对稳定聚集体,其物理和化学性
质由它所包含的原子数和原子空间结构决定,寻找原子团簇最优结构问题是计算机、物
理和化学等研究领域的一个非确定性多项式求解 (NP-Hard )难题。
本文主要介绍了金原子团簇和硼原子团簇的最优结构预测方法:
文章提出一种基于势能函数、群智能优化和机器学习的混合模型对原子团簇的稳态
结构进行预测。首先,基于给定的Au 和B− 团簇结构及其能量值,利用改进的粒子群优
20 45
化算法(IPSO )优化势能模型的参数,使模型最大程度匹配所给能量值。其次,为满足
机器学习模型的输入结构,建立库伦矩阵进行团簇结构信息的数据表征,并将转换后的
数据与第一步势能计算结果同时放入机器学习集成算法(Stacking )和神经网络门控循
环单元(GRU )中,利用所给Au 和B− 原子团簇的能量值训练模型,并将训练好的模型
20 45
-
分别用于后续预测Au 团簇和B 团簇的最优结构。此外,考虑到已有文献表明高度对称
的团簇结构具有较低的能量值,本文在第一题和第三题分别生成2 种基于有限对称的初
始团簇结构,并使用模拟退火算法(SA)逐步改变新解来使目标函数值(能量)减小,
迭代找到全局最优结构。进一步地,在第二题和第三题生成4 种基于有限对称和随机生
成的初始团簇结构,并对4 种结构类型的最优结构进行比较分析并验证其稳定性。结果
表明,本文提出的新型混合算法具有良好的收敛特性,并且从团簇的三维结构图中可以
得出,相比于其他3 种结构类型,全局最优的团簇结构具有明显的对称特性,并且这种
结构特性具有较高的稳定性。
关键词:群智能;机器学习;纳米团簇;结构预测
目 录
1 问题重述 1
1.1 研究背景 1
1.2 研究问题 1
2 问题分析2
2.1 针对金团簇的问题分析 2
2.2 针对硼元素的问题分析 2
3 模型假设3
4 符号定义与评价指标3
4.1 符号定义 3
4.2 评价指标 3
5 问题一的模型建立、求解与验证4
5.1 Gupta-IPSO-Stacking 能量预测模型 5
5.1.1 Gupta 势能函数 5
5.1.2 改进粒子群优化算法(IPSO)参数调优 5
5.1.3 库伦矩阵数据表征 7
5.1.4 集成算法(Stacking)预测能量 9
5.2 模拟退火算法预测全局最优结构 11
5.2.1 模拟退火算法 11
5.2.2 限制性对称初始结构生成 12
5.2.3 结构初始范围设定 13
5.2.4 全局最优结构预测结果 14
6 问题二的模型建立、求解与验证20
6.1 Au32原子团簇初始结构生成 20
6.1.1 限制性对称结构的生成 20
6.1.2 随机结构的生成 21
6.2 模拟退火算法预测全局最优结构 22
6.3 稳定性分析 24
7 问题三的模型建立、求解与验证25
7.1 Tersoff-IPSO-GRU 能量预测模型 25
7.1.1 Tersoff 势能函数 25
7.1.2 门控循环单元(GRU)预测能量 27
7.1.3 模型预测结果对比 28
7.2 基于模拟退火算法预测全局最优结构 28
7.2.1 B− 原子团簇初始结构生成 28
45
7.2.2 全局最优结构预测结果 29
8 问题四的模型建立、求解与验证31
8.1 硼B− 原子团簇初始结构生成 32
40
8.2 全局最优结构预测结果 33
8.3 稳定性比较 35
9 参考文献
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