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严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染对全球公共卫生构成了巨大威胁,预测病毒的进化方向对相关疾病的防控具有重大意义。SARS-CoV-2属于冠状病毒科β-冠状病毒属,其基因组为全长32 kb的正链RNA,复制酶转录酶复合物(nsp14)具有3→5核酸外切酶活性,该病毒的突变率高于双链DNA病毒,预示强大的进化潜能[1,2]。此外,SARS-CoV-2存在大量同工翻译产物,提示其变异较快并有较强的宿主适应性[3]。
基于冠状病毒的系统进化树,SARS-CoV-2与Bat-SL-CoV
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