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化学(chemistry)是在原子、分子水平上研究物质的组成、结构、性质、转化及其应用的基础自然科学。它源自生活和生产实践,并随着人类社会的进步而不断发展。[7]不同于研究尺度更小的粒子物理学与核物理学,化学研究的原子、分子、离子(团)的物质结构和化学键、分子间作用力等相互作用,其所在的尺度是微观世界中最接近宏观的,因而它们的自然规律也与人类生存的宏观世界中物质和材料的物理、化学性质最为息息相关。作为沟通微观与宏观物质世界的重要桥梁,化学则是人类认识和改造物质世界的主要方法和手段之一。
第六章 酶及其模拟;6.1 酶的组成、结构和功能;C: 水解酶:使肽、核酸、多糖、脂肪等可水解的结构进行水解
的酶.;E: 异构酶:促进各种异构化反应的酶( 消旋化反应中的消旋酶);6.1 酶的组成、结构和功能;C:反应条件温和:一般均在常温、常压下进行。
D:可自动调节活性:动物在运动和停止两种状态时所需能量 是不同的,运动时高,静止时低,该能量一般由糖或叫分解糖 原(glycogen)来供给, 而生产该糖原的串联酶组可以因外界 条件的变化而自动调节活性,运动时活性升高,静时降低,所 以很容易满足动物在不同状态下所需的能量,所以酶又叫做可 调节Cat。;6.1 酶的组成、结构和功能;(1)酶蛋白:蛋白质的一种,一般由20种左右的氨基酸以不同 排列组成,排列次序不同,结构不一样, 性质不一样, 氨基 酸组成可用通式表示如下;;亮氨酸(Leu), 异亮氨酸(Ile), 这些基团为惰性的和疏水的。;B:含-OH基的脂肪族和芳香基族;亲水的;蛋白质的初级序列:
当一个氨基酸分子的羰基与另一个氨基酸中的氨基缩合成一个 酰胺基团时,所形成的键称为肽键,;不同的动物体内,39个氨基酸排列稍有改变,但1号-24号,33
-39号的排序是一样的,只是25-32号不同.;(2) 辅因子
金属离子辅因子和有机辅因子
有机辅因子的分子类型多种多样,但大多与维生素有关, 总数也只有30个左右,重要的大概16种;6.1 酶的组成、结构和功能;FAD: 在反应中, 异咯嗪环成为氢的受体, 在NI及N5上添加二个 氢原子后, 氧化型核黄素即转化成还原型无色核黄素FADH2;辅 酶 在 催 化 中 的 作 用 : A:氧化还原型辅酶:起传递H和电子有关的作用 (见下图) 血红素(heme):为一种铁(+2)卟啉配合物,是过氧化物酶,
加氧酶以及细胞色素;其中的Fe为 Fe2+,可被O2氧化为Fe3+,通过价态变换传递H和电子e;;B: 传递转移其它基团的辅酶
(a): 硫胺素:它是使酮酸氧化 脱羧生成醛的各种酶的辅酶;(b): 吡哆醛磷酸:它是关联氨基酸代谢的辅酶,催化氨基酸中 的氨基的转移;6.1 酶的组成、结构和功能;它还可催化?-氨基酸上的脱羧反应:;C 金属离子:
一般来讲, 碱金属,碱土金属离子如K+,Na+,Mg2+ , Ca2+
是构成酶活性中心的组份;
在酶与反应物之间起桥梁作用。
支撑蛋白质的立体结构 过渡金属离子
A) 在氧化还原酶反应中参与电子的传递如:细胞色素中的Fe2+ 到Fe3+ , Cu2+-Cu+,
B)作为酶Cat的活性中心如Lewis酸与其它反应物以?-?成键形 成过渡态,而Hg, Pb, As, Cd金属离子则是酶的抑制剂,它们 与酶上的活性中心结合成键,从而使酶失去活性。;(1)氢键:酶是由若干氨基酸组成, 这样不同氨基酸通过肽键连接在;范德华力:即静电引力,不带电的残基R,无论是否有无极 性,相互之间可产生范德华力。
配位键: 有些蛋白质分子中含有过渡金属,过渡金属可以与 可提供电子对的原子之间形成?-?键配位键,例如:Mo-N ,Fe 与O之间。
离子键(盐键,盐桥):正负离子之间的静电引力形成的. 蛋白质分子中,N末端有NH3+,C末端有COO-,它们之间 NH3+---_OOC可形成离子键。另外,带电的残基也可与带反电 的R残基形成离子键。;(6) 二硫键(-S-S-): 如两个半胱氨酸,R: CH2-SH, 产生-S-S-键, 其键能为(30-100)*4187KJ/mol。而氢键大约为
8*4187KJ/mol。可见二硫键键能很大,是强的化学键。
6.1.4.2 酶的结构
(1)酶的一级结构(或基本结构单位):是由许多氨基酸的氨基 和羧基脱水缩合而形成肽键(-CO-NH-),并通过肽键联结而 成的一条长链(肽链)为酶的一级结构。
酶中所有的肽键结构都是一样的,呈平面,只有少数例外,键;(2) 酶的二级结构:
指多肽键的主链骨架中若干肽单位为了 形成氢键而各自沿一定的轴盘旋或折叠
成有一定规则结构的情况,一般形成
?-螺旋状(?-褶片)即
主链骨架中的NH和CO就形成了氢键, 这种次级键也正是?-螺旋状稳定的基础, 一般来讲,第一个肽键上的NH与第四 个肽键上的CO形成氢键。即每隔两个 钛键形成氢键,1与4,2与5, 3与6, 理论
上?-螺旋允许所有肽键参与链内氢键的形成.;(3) 酶的三级结构:指通过残基基团相互作用,使多钛链的二级 结构在空间进一步卷曲,折叠并借助于次级键形成稳定的三 维结构。
这种三级结构主要是 不同的残基,通过图示 的多种作用力相互作用 而形成的.大量研究事 实认为:
那些带电荷的极性基 团,由于能根据周围环
境的pH值而带有电荷或不带电荷、然后通过静电吸引力或斥力 的
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