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蛋白质互作技术研究进展
摘要:蛋白质作为细胞活性及功能的执行者,以复杂有序的动态互作协调着细胞的增殖与分化、衰老与死亡以及环境应答等各种重要生理过程。重点介绍了酵母双杂交系统、双分子荧光互补、噬菌体展示技术、荧光共振能量转移技术、谷胱甘肽巯基转移酶融合蛋白沉降技术、免疫共沉淀技术等蛋白质互作研究技术的原理及在生物学中的应用,以及生物信息学在蛋白质互作研究中的应用,并对目前及未来蛋白质互作技术的发展方向进行了探讨。
关键词:蛋白质;生物信息;蛋白质互作
中图分类号:q51文献标识码:a
文章编号:0439-8114(2019)12-0005-06
abstract:proteins,thetrueexecuterofcellactivitiesandfunctions,playimportantrolesintheproliferation,differentiation,aginganddeath,andenvironmentalresponseviacomplexandhighlyordereddynamicinteraction.thebasicprinciplesandapplicationsofseveralrelatedresearchtechniquesinprotein-proteininteractions,includingyeasttwo-hybridsystem,bimolecularfluorescencecomplementationassay,phagedisplaytechnology,fluoresenceenergytransfer,gstpull-down,co-immunoprecipitation,andbioinformaticsinproteininteractionresearchapplications,andtheirdevelopmentprospectswerealsoprospected.
keywords:protein;bioinformatics;proteininteraction
2003年4月,人類基因组测序的完成,标志着生命科学正式进入后基因组时代,生命科学从单纯研究基因序列信息转向对基因功能的深入解析,蛋白质组学成为研究热点。蛋白质不能单独发挥作用,需依靠蛋白质与蛋白质之间的相互作用发挥功能。蛋白质与蛋白质之间相互作用即蛋白质互作(protein-proteininteraction,ppi)是细胞生化反应网络的一个重要组成部分,在新蛋白质及相关蛋白质复合物的发现、鉴定与功能验证,以及细胞信号转导、细胞代谢等研究方面发挥了关键作用,成为蛋白质组学研究的重要区域。通过ppi发现,当细胞凋亡发生时不同的热激蛋白质家族成员都广泛参与凋亡信号通路[1];线粒体抗病毒信号蛋白质(mavs)作为一种接头蛋白质在调节宿主天然免疫信号通路过程中扮演着重要角色[2]。
蛋白质本身是多种多样的,每种蛋白质的独特生理属性影响着蛋白质间的相互作用,在体外试验分析重组蛋白质的表达,会导致机体内内含物的形成从而妨碍其功能的实现[3]。蛋白质间的互作也存在不同层次的复杂性,如:多亚基酶的纳米机制[4]、分子伴侣与靶蛋白质的互作[5]、蛋白质激酶与靶蛋白质互作[6]、代谢网络中多种蛋白质的互作[7]。因此,完全精准解读蛋白质的相互作用原理及功能,需要更加高效科学的ppi技术。
1蛋白质互作技术
随着生物技术的不断发展,ppi技术得到了极大改善,试验过程变得简化,试验结果更加准确。目前ppi技术主要包括酵母双杂交(yeasttwo-hybrid)系统、双分子荧光互补(bimolecularfluorescencecomplementationassay,bifc)、噬菌体展示技术(phagedisplaytechnology,pdt)、荧光共振能量转移(fluorescenceresonanceenergytransfer,fret)技术、胱甘肽巯基转移酶融合蛋白沉降(glutathiones-transferasepull-downassay,gstpull-downassay)技术、免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,co-ip)技术和far-westernblotting等多种研究ppi的技术。
1.1酵母双杂交系统
酵母双杂交是1989年由fields等[8]首次应用在真核生物酵母转录因子gal4特性的研究中。酵母双杂交技术是建立在模式生物酵母之上,原理是酵母细胞起始基因转录需要有转录激活因子的参与,其在结构上是组件式
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