核酸的结构与功能 (9).pptVIP

①氨基酸臂 ：7bp组成，富含G，5’-pG或pC，3’-CCA-OH，氨基酸连接在腺苷酸残基(A)上 。 ②TψC环：由7个碱基组成，参与tRNA与核糖体表面的结合。 ③额外环或可变环(extro variable loop)。碱基种类和数量（3~18个碱基）高度可变，并富含稀有碱基。环的大小与生物种类有关，作为tRNA分类的指标。 ④反密码子环(anti-cordon loop)。由7个碱基组成，处于中间位的3个碱基为反密码子，常含有次黄嘌呤核苷酸。反密码子可与mRNA中的密码子结合。 ⑤二氢尿嘧啶环(D-loop)由8~12个碱基组成，具2个二氢尿嘧啶(DHU)。 第八十七页，共一百一十九页，2022年，8月28日 ⑷tRNA的三级结构 tRNA的三维结构(three dimensional structure) 是倒“L”形。 第八十八页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第五十五页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第五十六页，共一百一十九页，2022年，8月28日 一条多核苷酸链上的嘌呤碱基与另一条多核苷酸链上的嘧啶碱基以氢键相连，配对原则是A=T，C ? G。 碱基层叠于螺旋内侧，碱基平面与纵轴垂直，碱基之间距离为0.34nm。磷酸和脱氧核糖在外侧，彼此之间通过磷酸二酯键连接。糖环平面与中轴平行。 螺旋直径2nm；螺旋周期包含10bp；螺距3.4nm；相邻碱基对平面的间距0.34nm。 第五十七页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第五十八页，共一百一十九页，2022年，8月28日 ⑶双螺旋结构的稳定因素 氢键、碱基堆集力。层层堆集的芳香族碱基上的疏水作用力和范德华力，使DNA双螺旋结构内部形成疏水核心而不存在游离的水分子，有利于互补碱基间形成氢键； 同时，双螺旋外侧带负电荷的磷酸基团同带正电荷的阳离子之间形成的离子键可减少双链间的静电斥力，因而对DNA双螺旋结构也有一定的稳定作用。碱基分子内能。 第五十九页，共一百一十九页，2022年，8月28日 （4）DNA双螺旋构象的多态性 在多核苷酸链中，戊糖能折叠成多种构象，同时，分子还可绕C-N糖苷键以及3’,5 ’ -磷酸二酯键旋转一定角度，使得具有同样碱基配对的DNA双螺旋可以采取不同的构象，这种构象上的差异称为多态性。 在溶液中，DNA一般为B型。在以钠、钾或铯作反离子，相对湿度为75％时，DNA分子的X-射线衍射图显示的是A-构象。 A-构象不仅出现于脱水DNA中，还出现在RNA分子中的双螺旋区和DNA-RNA杂交分子中。 第六十页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第六十一页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第六十二页，共一百一十九页，2022年，8月28日 B-DNA与A-DNA的比较 第六十三页，共一百一十九页，2022年，8月28日 Z-DNA Wang和Rich等在研究人工合成的d（CGCGCG）单晶的X-射线衍射图谱时，发现这种六聚体的构象不同于B-构象。 它是左手双螺旋，在主链中各个磷酸根呈锯齿（Zigzag）状排列，因此称Z-构象。 第六十四页，共一百一十九页，2022年，8月28日 B-DNA与Z-DNA的比较 第六十五页，共一百一十九页，2022年，8月28日 天然DNA分子中存在有Z-DNA区。B-DNA与Z-DNA的互变可能与基因的调控有关。 如胞嘧啶C5的甲基化，在甲基周围形成局部的疏水区。这一区域扩伸到B-DNA的大沟中，使B-DNA不稳定而转变为Z-DNA。这种C5甲基化现象在真核生物中是常见的。 第六十六页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第六十七页，共一百一十九页，2022年，8月28日 利用X-射线衍射技术时的样品分析条件与被测DNA分子的天然状态相差甚远，在反映DNA结构真实性方面这种方法存在着缺陷。 1989年，应用扫描隧道显微镜(STM)可克服X-射线衍射技术的缺陷（分辨率10-10m）。 STM可将被测物放大500万倍，且能直接观测接近天然条件下单个DNA分子的结构细节。它所取得的DNA结构资料更具有“权威性”。STM证实了d(CG)重复序列的寡核苷酸片段为Z-DNA结构的事实。 第六十八页，共一百一十九页，2022年，8月28日 （5）三链DNA（H-DNA） 在三链DNA中，polyPy和polyPu形成反向平行的双螺旋，碱基以Watson-Crick方式配对，第三股链则以结合于大沟中。 在三链DNA中，位于大沟中的多聚嘌呤链与双链DNA中的多聚嘌呤链成平行走向，碱基按照Hoogsteen方式配对形成TAT，CGC三联体。 作用：与基因表达调控有关，第三股链可能阻碍一些调控蛋白或RNA聚合酶与DNA结合。 第六十九页，共一百一十九页，2022年，8月28日 第七