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会计学
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实验六植物组织基因组DNA的提取与分析CTAB法
2
(1)掌握植物组织中DNA提取的原理和方法。
(2)掌握DNA的琼脂糖凝胶电泳检测方法
一、实验目的
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二、实验原理
通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
CTAB, SDS等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。
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二、实验原理
再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。
上清液中加入异丙醇或乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于双蒸水或TE溶液中,即得植物总DNA溶液。
之后可加入RNA酶降解其中的RNA,再用氯仿除去RNA酶,得到较纯的DNA制剂。
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CTAB法流程图:
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三、仪器和试剂
1、仪器:
恒温水浴锅、高速离心机、水平电泳槽、电泳仪。
2、试剂:
液氮、CTAB提取缓冲液、氯仿:异戊醇(24:1)、异丙醇、70%乙醇、TE缓冲液、上样缓冲液(0.5%溴酚蓝+40%蔗糖)、1×TAE电泳缓冲液。
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四、实验步骤
1、DNA的提取
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四、实验步骤
2、DNA电泳检测
(1)1%琼脂糖凝胶:称取琼脂糖,加入30mL 1×TAE缓冲液,在微波炉中加热,反复加热、振荡2-3次,使琼脂糖充分融化。待凝胶冷却至60℃左右,倒入插入梳子的凝胶板中(避免产生气泡),让凝胶自然凝固。
(2)待凝胶凝固后,小心拔出梳子,避免前后左右摇晃,以免破坏胶面及加样孔,小心将凝胶和胶床放入电泳槽中,加样孔靠近阴极的一端。
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四、实验步骤
2、DNA电泳检测
(3)上样电泳:将20μLDNA样品溶液和5μL上样缓冲液混匀后,上样,100V稳压电泳检查,根据指示剂迁移的位置,判断是否中止电泳。切断电源后,再取出凝胶。
(4)照胶、拍照:将凝胶泡在EB溶液(注意:EB溶液为剧毒物,需带上一次性手套拿取凝胶)中10min左右,进入暗室,使用凝胶成像系统照胶并拍照。
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五、实验结果与分析
将凝胶图片打印出来,需要说明:
1、小组点样孔号;
2、DNA质量分析。
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六、注意事项
(1)叶片磨得越细越好。
(2)移液器的使用。
(3)由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步(研磨)的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。
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1、在DNA抽提过程中造成DNA分子断裂的主要因素有哪些?
2、本实验中所用到下列试剂(CTAB、氯仿、异丙醇、75%乙醇)的作用各是什么?
七、思考题
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