蛋白质的结构.pdf

- 蛋白质的构造： 蛋白质分子是由氨基酸首尾相连而成的共价多肽链，但是天然蛋白质分子并不是走向随机的 松散多肽链。每一种天然蛋白质都有自己特有的空间构造或称三维构造，这种三维构造通常被称 为蛋白质的构象，即蛋白质的构造。 一级构造：构成蛋白质的单元氨基酸通过肽键连接形成的线性序列，为多肽链。 一级构造稍有变化，就会影响蛋白质的功能。 二级构造：一级构造中局部肽链的弯曲或折叠产生二级构造。多肽链的*些局部氨基酸残基周 期性的空间排列。现已报道的蛋白质中二级构造共有四种: α-螺旋，β-折叠，β-转角，无规卷曲。 α-螺旋:它是蛋白质当中最为常见的二级构造(图 1.2 (左))。它的每个螺旋周期有 3.6 个氨基酸 残基，其残基侧链伸向外侧，同一肽链上的每个残基的酰胺氢原子和位于它后面的第 4 个残基上 的羰基氧原子之间形成氢键，并且与螺旋轴保持大致上的平行。此外，肽键上的酰胺氢和羰基氧 既能形成内部氢键，也能与水分子形成外部氢键。α-螺旋的稳定性很好，除甘氨酸及脯氨酸外的 其他各种氨基酸通过肽键构成主链时都有形成 α-螺旋的倾向。 β-折叠：它也是常见的蛋白质二级构造之一。与 α-螺旋不同，它呈片状(,肽链几乎完全伸展 的，而非严密卷曲。此外，β-折叠中相邻两个氨基酸的轴向距离为 3.5A;，而不是 α-螺旋中的 1.5A。β-折叠片中，相邻的两个多肽片段可能是彼此平行的，也可能是反平行的。在蛋白分子 内部更多出现的是平行的 β-折叠片；而反平行的 β-折叠片一段暴露于溶剂中，一段埋于蛋白内 部，其氨基酸序列常为亲水和疏水的氨基酸交替排列。 β-转角：它大多分布在球状蛋白质分子外表，以改变肽链。它是一个发夹式转折，其特点是 在于多肽链中第 n 个残基的一 CO 基与第 n+3 个残基的-NH 基形成氢键。因此，一个多肽链的走 向可以得到很好的扭转。因此，β-转角在球状蛋白质中是重要的二级构造，起到连接其他二级构 造的作用。 . z. 无规卷曲：它是指没有确定规律性的但拥有严密有序的稳定构造的肽链构象，主链间可形成 氢键，主链与侧链之间也可以形成氢键。这些氢键共同维持了它构造上的稳定。无规卷曲大体上 分为两种，即严密环和连接条带。 卷曲所形成的二级构造称为 α-螺旋，折叠所形成的二级构造称为折叠片。这两种二级构造的 形**是 由于距离一定的—N—H 基团和—C=O 基团之间形成氢键的。 三级构造：在二级构造根底上进一步折叠成严密的三维形式。三维形状一般都可以大致说是 球状的或是纤维状的。 四级构造：由蛋白质亚基构造形成的多于一条多肽链的蛋白质分子的空间排列。 超二级构造：是指在多肽链内顺序上相互邻近的二级机构常常在空间折叠中靠近，彼此相互 作用，形成规则的二级构造聚集体。 万有引力与重力的关系 地面附近的物体由于地球的吸引而受到重力作用，但是物体所受重力一般并不等于同与地 球对物体的万有引力。地球对物体的万有引 力产生两个效果 ：一是使物体随地球一起参 与地球的自转，一是使物体落向地面 〔或压 在地面上〕，也就是说，万有引力可以分解为 两个力，即维持物体随地球 自转也就是绕地 轴做匀速圆周运动所需的向心力以及重力， 如下列图，图中 F 为纬度处*一物体所受地球 之万有引力，F 使该物体随地球 自转而沿纬 1 圈做圆周运动所需向心力，G 为物体所受重 力 mg。由图可知，重力的大小一般不等于万有引力 F，方向一般也不并指向地球中心 ，只有两极 和赤道处重力方向才指向地心 。 不同纬度处物体随地球 自转做圆周运动的半径不同，所 需 - 向心力 F 也随之变化，物体所受重力的大小也变化，即地面附近的重力加速度应随纬度变化。我 1 们近似的将地球看成分层均匀的圆球体，来讨论重力加速度随纬度变化的规律。在这种条件下， GMm