酶切位点 识别序列 .docxVIP

酶切位点（ 酶切位点（ Restriction Enzyme cutting site ）：DNA 上一段碱基的特定序列， 限制性内切酶 限制性内切酶 能够识别出这个序列并在此将 DNA 序列切成两段。 可能存在同尾酶，不同酶的识别序列不同， 有的可能能识别多个酶切位点比如 STY1 识别序列有 WW PCR 引物设计时酶切位点的保护碱基表 不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求（在本表中没有列出的 酶，则通常需在识别位点两端至少加上 6 个保护碱基，以确保酶切反应的进行。 ） 保护碱基：当酶切位点在双链 DNA 的尾端时，限制性内切酶经常不能成功切断(简 单的想象为酶遇到识别位点之后从旁边掉下去了…… =_=|||)所以经常在引物设计时，在末端的限制性内切酶识别位点之后再加上 2 单的想象为酶遇到识别位点之后从旁边掉下去了…… =_=|||)所以经常在引物设计 时，在末端的限制性内切酶识别位点之后再加上 2、3 个碱基以确保成功酶切。比 如 你 的 引 物 是 5‘ GCTAGCNNNNN…… 3’ 可 以 改 成 5‘ CAGGCTAGCNNNNN…… 3’ 呃……CAG 是我随便加的，你可以考虑一下 CG/AT 含量 酶 寡核苷酸序列 链长 2 切割率% hr 20 hr GGTCGACC 8 0 0 Acc I CGGTCGACCG 10 0 0 CCGGTCGACCGG 12 0 0 CACATGTG 8 0 0 Afl III CCACATGTGG 10 90 90 CCCACATGTGGG 12 90 90 GGCGCGCC 8 90 90 Asc I AGGCGCGCCT 10 90 90 TTGGCGCGCCAA 12 90 90 CCCCGGGG 8 50 90 Ava I CCCCCGGGGG 10 90 90 TCCCCCGGGGGA 12 90 90 BamH I CGGATCCG 8 10 25 CGGGATCCCG CGGGATCCCG 10 90 90 CGCGGATCCGCG 12 90 90 CAGATCTG 8 0 0 Bgl II GAAGATCTTC 10 75 90 GGAAGATCTTCC 12 25 90 GGCGCGCC 8 0 0 BssH II AGGCGCGCCT 10 0 0 TTGGCGCGCCAA 12 50 90 BstE II GGGT(A/T)ACCC 9 0 10 AACTGCAGAACCAATGCATTGG 22 0 0 BstX I AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA 24 25 50 CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT 27 25 90 CATCGATG 8 0 0 GATCGATC 8 0 0 CCATCGATGG 10 90 90 CCCATCGATGGG 12 50 50 GG^AATTCC 8 90 90 EcoR I CGG^AATTCCG 10 90 90 12 90 90 CCGG^AATTCCGG GGGGCCCC 8 90 90 Hae III AGCGGCCGCT 10 90 90 TTGCGGCCGCAA 12 90 90 CA^AGCTTG 8 0 0 Hind I II CCA^AGCTTGG 10 0 0 12 10 75 CCCA^AGCTTGGG Kpn I GGGTACCC GGGGTACCCC 8 0 10 90 0 90 CGACGCGTCG102550CCCATGG CGACGCGTCG 10 25 50 CCCATGGG 8 0 0 Mlu Nco I I Nde I 12 90 8 0 90 0 CATGCCATGG CATGCCATGGCATG 14 50 75 CCATATGG 8 0 0 CCCATATGGG 10 0 0 CGCCATATGGCG 12 0 0 GGGTTTCATATGAAACCC 18 0 0 GGAATTCCATATGGAATTCC 20 75 90 GGGAATTCCATATGGAATTCCC 22 75 90 GGCTAGCC 8 0 0 Nhe I CGGCTAGCCG 10 10 25 CTAGCTAGCTAG 12 10 50 TTGCGGCCGCAA 12 0 0 ATTTGCGGCCGCTTTA 16 10 10 Not I AAATATGCGGCCGCTATAAA 20 10 10 ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT 24 25 90 AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA 28 25 90 TGCATGCATGCA 12 10 90 Nsi I CCAATGCATTGGTTCT