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生物化学笔记 第一章 蛋白质的结构与功能 第一节 蛋白质的分子组成 一、蛋白质的元素组成 碳50~55%、氢6%~7%、氧19%~24% 、氮13%~19%,硫0~4% 。有的蛋白质含有磷、 碘。少数含铁、铜、锌、锰、钴、钼等金属元素。 蛋白质的含氮量平均为16%, 每克样品中含氮克数×6.25×100=100克样品中蛋白质含量(克% ) 二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸(amino acid ) 1、氨基酸的结构通式 天然蛋白质的基本氨基酸共20种。为 L-α-氨基酸(甘氨酸除外)生物界中也发现一些 D 系 氨基酸,主要存在于某些抗菌素以及个别植物的生物碱中。 2 、氨基酸的分类 按其 α-碳原子上侧链 R 的结构和理化特性的不同可分为: 1)非极性疏水性氨基酸: 氨基酸的 R 基团不带电荷或极性极微弱的,如:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮 氨酸、蛋氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、脯氨酸。R 基团具有疏水性。 2 )极性中性氨基酸: R 基团有极性,但不解离,或仅极弱地解离,它们的 R 基团有亲水性。如:丝氨酸、苏氨 酸、半胱氨酸、酪氨酸、谷氨酰胺、天门冬酰胺。 3 )酸性氨基酸: R 基团有极性,且解离,在中性溶液中显酸性,亲水性强。如天门冬氨酸、谷氨酸。 4 )碱性氨基酸: R 基团有极性,且解离,在中性溶液中显碱性,亲水性强。如组氨酸、赖氨酸、精氨酸。 3、氨基酸的理化性质 1)两性解离及等电点 氨基酸分子都含有碱性的 α-氨基和酸性的 α-羧基,因而是一种两性电解质。在溶液中其所 带电荷取决于溶液的 pH 值,当氨基酸分子带有相等正、负电荷,即所带净电荷为零时, 溶液的 pH 值称为该氨基酸的等电点(pI )。 2 )紫外吸收性质 色氨酸、酪氨酸吸收峰在280nm 左右,苯丙氨酸吸收峰在254nm 。 可利用此性质采用紫外 分分光度法测定溶液中蛋白质的含量,该法简便快捷。 3 )茚三酮反应 氨基酸可与茚三酮缩合产生蓝紫色化合物,其最大吸收峰在570nm 。可利用此性质测定氨 基酸的含量。 四、蛋白质的分类 (一)组成:单纯蛋白质及结合蛋白质 (二)蛋白质分子形状:球状蛋白质及纤维状蛋白质 (三)蛋白质的功能: 活性蛋白质:酶、激素蛋白质、运输和贮存蛋白质等 非活性蛋白质:胶原、角蛋白等 第二节 蛋白质的分子结构 蛋白质为生物高分子物质,具有三维空间结构,执行复杂的生物学功能。蛋白质结构与功 能之间的关系密切。将蛋白质分子结构分为一级、二级、三级、四级结构四个层次,后三 者统称为高级结构或空间构象 (conformation )。 一、蛋白质的一级结构 1、概念: 蛋白质的一级结构就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(sequence )。 由基因上遗传密码的排列顺序所决定。氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成 为多肽链,肽键是蛋白质结构中的主键。 蛋白质的一级结构决定了蛋白质的二级、三级等高级结构。 二、蛋白质的二级结构 蛋白质分子的多肽链并非呈线形伸展,而是折叠和盘曲构成特有的比较稳定的空间结构。 蛋白质的生物学活性和理化性质主要决定于空间结构的完整,蛋白质的空间结构就是指蛋 白质的二级、三级和四级结构。 (一)蛋白质的二级结构 1、概念: 蛋白质的二级结构(secondary structure )多肽链中主链原子的局部空间排布即构象,不涉 及侧链部分的构象。维系蛋白质二级结构的主要化学键是氢键。 2 、肽键平面(或称肽单位,peptide unit ) (1)中的C-N 键长0.132nm ,比相邻的N-C 单键(0.147nm )短,而较一般C=N 双键 (0.128nm )长,肽键中-C-N-键的性质介于单、双键之间,具有部分双键的性质,因而不 能旋转,这就将固定在一个平面之内 (2 )肽键的C 及 N 周围三个键角之和均为360°,六个原子基本同处一个平面,肽链中能 够旋转的只有 α 碳原子所形成的单键,此单键的旋转决定两个肽键平面的位置关系,肽键 平面成为肽链盘曲折叠的基本单位。 3、蛋白质主链构象的结构单元 蛋白质的二级结构主要包括 α-螺旋,β-折迭,β-转角及无规卷曲 ●α——螺旋 (1)多个肽键平面通过α -碳原子紧密盘曲成稳固的右手螺旋。 (2 )主链呈螺旋上升,每3.6个氨基酸残基上升一圈,螺距0.54nm 。 (3 )相邻两圈螺旋之间借肽键中C =O 和 N-H 之间形成许多链内氢健,每一个氨基酸残 基中的 NH 和前面相隔三个残基的 C =O 之间

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