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生物化学蛋白质生物合成; 第一节 蛋白质生物合成体系; 翻译的模板:DNA----原始模板 RNA----直接模板 翻译的场所:核蛋白体(细胞质) 翻译过程分为起始、延长、终止三个阶段。;翻译(蛋白质的生物合成)所需物质:
以氨基酸为原料
以mRNA为模板
以tRNA为运载工具
以核糖体为合成场所
起始、延长、终止各阶段蛋白因子、 ATP和GTP 、无机离子参与
合成后加工成为有活性蛋白质;一、遗传密码和mRNA
二、t RNA
三、核糖体
四、辅助因子;遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。
原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron) 。
真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron) 。 ;;原核细胞mRNA的结构特点;真核细胞mRNA的结构特点;遗传密码:
DNA(或mRNA)中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码。
;密码子
mRNA分子上从5?至3?方向,由AUG开始,每3个连续的核苷酸为一组,决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号,称为密码子( codon )或三联体密码(triplet coden)。; 第 三 个 字 母; 密码子的特点:★★
1 、连续性
编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉,如mRNA链上的碱基发生插入或缺失,可造成框移突变。
开放读码框:从mRNA5’端起始密码子AUG到3’端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放读码框(open reading frame,ORF);2、密码的简并性: 是指一种氨基酸有2个或2个以上的密码子为之编码的现象。; 反密码子与密码子之间的碱基配对;3、密码的摆动性(变偶性):
密码子与反密码子配对出现不严格遵守常见的碱基配对规律的情况,称为摆动配对
;密码子与反密码子的摆动配对;; 人线粒体中变异的密码子;二.氨基酸的“搬运工具”----tRNA;;第22页/共90页;种类;原核生物
起始tRNA
延长tRNA
真核生物
起始tRNA
延长tRNA;三、核糖/蛋白体;;★★;第二节 蛋白质???物合成过程; 一、tRNA与氨基酸的活化 (一)氨基酰-tRNA合成酶 tRNA的3’末端-CCA-OH是氨基酸的结合位点,tRNA的功能是转运氨基酸。 1.tRNA携带氨基酸的反应如下:(氨基酸的活化) 此反应可分为两步完成: 氨基酸+ATP-E → 氨基酰-AMP-E+PPi 氨基酰-AMP-E+tRNA→氨基酰-tRNA+AMP+E; 2.氨基酰-tRNA合成酶的作用特点★★ a. 对aa、tRNA两种底物有高度特异性; b.有校正活性,当发生错配时,可以水解酯键,再重新与正确的底物结合。 3.氨基酰-tRNA的书写 (1) 氨基酰-tRNA完整的写法是:ala-tRNAala;met-tRNAemet;fmet-tRNAfmet等。 (2) 各种氨基酰-tRNA的生成反应如下:gly + tRNAgly + ATP → gly-tRNAgly + AMP + PPi met+tRNAemet+ATP → met- tRNAemet +AMP+PPi ; (二)起始肽链合成的氨基酰-tRNA 密码子AUG为甲硫氨酸(Met)编码,同时作为起始密码。 与甲硫氨酸结合的tRNA,真核生物中至少有两种:tRNAimet和tRNAemet ;原核生物的起始密码只能辨认甲酰化的甲硫氨酸,即N-甲酰甲硫氨酸( fMet )。; 二、肽链合成起始 肽链合成起始阶段,是指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物的过程。需要起始因子(IF或eIF)和ATP、GTP参与。; (一)原核翻译起始复合物形成 (图) 1. 蛋白体大、小亚基分离。 2.mRNA在小亚基定位结合; S-D序列:又称核蛋白体结合位点(ribosomal binding site,RBS) 是mRNA起始密码上游的一段富含嘌呤核苷酸的序列,该序列以…AGGA…为核心。(图1) 3.起始氨基酰-tRNA在小亚基上就位; 4.核蛋白体大亚基结合。;第34页/共90页;;;;; (二)真核生物翻译起始复合物形成 1.核蛋白质体
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