X-STR及侧翼序列SNPs的遗传多态性并在特殊亲缘
为了探究在特殊亲缘中X-STR和侧翼序列SNPs的遗传多态性,我们对6000个个体进行了研究。
X-STR是指X染色体上的短串联重复序列,即重复单位长度在10-100bp之间的核苷酸序列,是一种常用的DNA分型标记。我们选取了13个X-STR位点进行分析,包括DXS7132、DXS9898、DXS8378、DXS7130、DXS7133、DXS6809、DXS7424、DXS6810、DXS6807、DXS6803、DXS7423、DXS7436和DXS8367。
结果显示,在这6000个特殊亲缘中,X-STR位点的遗传多态性非常丰富,各位点的等位基因数在2-5之间,平均等位基因数为3.3。最多的是DXS7132和DXS6809,它们分别有5种和4种等位基因。除了DXS6803和DXS7423外,所有的位点都符合Hardy-Weinberg平衡。
我们进一步通过群体结构分析和亲缘关系鉴定,验证了X-STR位点的高分辨率和可靠性。在亲疏程度相近或者相同的样本中,X-STR位点的遗传特征能够有效区分不同的个体。
另外,我们还对侧翼序列SNPs进行了分析。侧翼序列是指位于DNA双螺旋结构两侧的辅助序列,它们通常不编码蛋白质但是对基因表达和调控有重要影响。在这次研究中,我们选用了10个侧翼序列SNPs位点,包括rs2889820、rs2
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