高通量测序筛选促进心脏再生的长链.docx

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高通量测序筛选促进心脏再生的长链 在过去的几十年中,心脏疾病成为全球最致命的疾病之一,影响了数百万人的生命质量和寿命。尽管心血管疾病的临床治疗已经有显著的进展,但是心脏肌细胞 (CMs) 细胞的低自我修复能力和有限再生能力使得心脏病变后的心肌细胞几乎无法再生,从而给治疗带来了巨大的挑战。因此,心脏疾病的治疗领域面临着重大的挑战,需要探索全新的治疗方法。 在过去几年中,长链非编码 RNA (lncRNA) 被证明在心脏发育和心脏疾病的发生发展中发挥了重要的调控作用。神经内分泌 X 基因 (NEXN-AS1) 是一种相对较新被发现的 lncRNA,被证明具有在心脏肌细胞再生中的重要功能。然而,尚不清楚 NEXN-AS1 与心脏再生之间的分子机制。 高通量测序 (High-throughput sequencing,HTS) 已经成为解析基因表达和调控、发现潜在疾病标志物、筛选药物靶点的重要技术。在本研究中,我们利用 HTS 筛选了与 NEXN-AS1 基因相互作用的潜在基因,研究了 NEXN-AS1 与心脏肌细胞再生之间的分子机制。 首先,我们通过 RNA-sequencing 技术分析了心肌梗塞 (MI) 损伤后心肌组织中 NEXN-AS1 的表达水平,并发现在心肌梗塞后 NEXN-AS1 的表达水平显著上调。然后,我们使用多个生物信息学工具的分析,对 NEXN-AS1 的互作蛋白进行预测,并鉴定了其相互作用的潜在蛋白。我们利用 HIS-tagged pull-down 实验和突变分析技术证实了 GREB1 和 NEXN-AS1 之间的直接相互作用。 接下来,我们筛选了 GREB1 在心肌梗塞后与 NEXN-AS1 共同调控的潜在基因。我们发现,GREB1/NEXN-AS1 联合调控的基因主要与细胞再生、脂代谢、心肌细胞肌纤维组织和非典型淋巴细胞激活有关。这些基因中的一些已经被报道与心脏再生和心肌重构相关。例如,NIPBL 和 Wnt 通路成员和 Foxm1,这两个基因都与心肌再生相关。 最后,我们利用 CRISPR-Cas9 基因编辑技术进一步证实了 NIPBL 和 Wnt 通路成员和 Foxm1 与 NEXN-AS1 和 GREB1 相互作用,同时调控心肌细胞再生。这些实验结果进一步支持了 NEXN-AS1 和 GREB1 与心肌再生相关,并揭示了 NEXN-AS1 和 GREB1 调控心脏细胞再生的基因网络。 综上所述,本研究利用高通量测序技术,发现了 NEXN-AS1 与 GREB1 相互作用,并调节心肌再生的分子机制,同时鉴定了 GREB1/NEXN-AS1 的共同调控基因。这些结果为研究心肌再生新机制,发展心脏病的治疗方法提供了新的思路和理论基础。

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