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基因工程载体B;噬菌体:感染细菌的病毒;病毒与宿主关系来分:
温和性病毒
构建载体的好材料
烈性病毒
通过改造,也可用于构建载体;病毒克隆载体应用的局限性:温和性病毒和烈性病毒都存在严格的宿主专一性;一. 噬菌体;三类典型形态的病毒:;噬菌体的生命周期分为: 溶菌周期和溶源周期;烈性噬菌体的繁殖途径Phage reproductive cycle;温和噬菌体的繁殖途径;λ溶源性细菌特点:
超感染免疫性(抗御同种噬菌体再次感染的特性)
溶源性细菌可诱发进入溶菌周期(OL、OR摆脱cI阻遏蛋白后进入该周期)
;c、λ噬菌体在宿主体外与蛋白质结合包装成为含双链线状DNA的颗粒,分为四个区。;线状λ噬菌体基因组的四个区:左侧区、中间区、右侧区(调控成分、复制基因O和P、溶菌基因S和R)和末端结构 (λ噬菌体的DNA在噬菌体中是线状DNA分子,基因组是一长约 48502bp 的双链DNA);λ噬菌体cos位点;att位点
attL attR;包装限制:离体条件下,将重组体DNA包入噬菌体等病毒颗粒中以形成有功能的病毒载体;
λ噬菌体头部外壳蛋白质容纳DNA的能力:
上限:野生型DNA总量(48kb)的5%左右
低限:野生型DNA总量(48kb)的75%;溶菌途径:λ噬菌体感染Ecoli后,线形λ DNA注入细胞内,若进入溶菌生长途径,则粘性末端连接成环状DNA分子,指令宿主细胞合成与包装相关的系列壳蛋白和酶,复制出新的λDNA,包装成子代噬菌体颗粒,并在R蛋白和S蛋白的作用下,宿主细胞破裂,释放出大量子代噬菌体颗粒,感染新的细胞。;代表性λ噬菌体载体;置换型;置换型;插入型载体 置换型载体 ;插入型载体的克隆能力;置换型(取代)载体的克隆能力;(2)标记基因
噬菌斑:透明(有外源DNA插入)和混浊
α-互补现象:蓝白斑、红白斑
Spi- :外源DNA取代red、gam基因,
能在P2噬菌体溶源性细菌中生长;宿主细胞中λ噬菌体的包装过程;头部:
E蛋白占72%:头部主要组成成分
琥珀突变使λ噬菌体不能形成头部结构,导致尾部蛋白累积
D蛋白占20%: λDNA进入头部前体
以及头部成熟作用
琥珀突变使得λ噬菌体DNA不能进入头部,头部蛋白累积;λ噬菌体头部和尾部的体外??配是分开进行的;D基因缺失突变株(D-):
溶原菌菌株BHB2690
E基因缺失突变株(E-)
溶原菌菌株BHB2688
;注意:λ噬菌载体+外源DNA的大小: 36kb~52kb
体外包装:λ噬菌载体 + 尾部蛋白 + 头部蛋白 ;第29页/共93页;二.粘粒(cosmid);粘粒定义:
包含λ噬菌体cos位点的质粒,因此,质 粒DNA在体内可以被噬菌体衣壳蛋白包裹;第32页/共93页;粘粒的特点:
(1)具有部分λ噬菌体特点
体外包装后,高效转导敏感型大肠细胞,
进入后环化
(2)具有质粒特点
复制、抗性
(3)高容量克隆能力
极限可达45kbp;λ噬菌体包装必备条件:;Cosmid克隆载体;pHC79;部分柯斯质粒的基本特性;柯斯质粒载体的特点:
1)具有λ噬菌体的特性(但因不含全部必需基因,因此不能通过溶菌周期,无法形成子代噬菌体颗粒)
2)具有质粒的特性(有质粒复制子及抗菌素基因)
3)具有高容量的克隆能力(本身仅5-7kb, 克隆极限可达45kb左右)
4)具有与同源序列质粒进行重组的能力
广泛应用于基因组DNA文库的构建;柯斯克隆(cosmid cloning);(如EcoR I);M13噬菌体;M13噬菌体的特点
感染Ecoli后,在宿主细胞内形成双链的复制型DNA(replication form DNA, RF DNA),可以象质粒DNA那样在体外进行纯化和操作。
成熟的噬菌体颗粒仅能感染E.coli的F+细胞(噬菌体的感染位点在性散毛上)。但RF DNA或ss DNA都能转染E.coli的F+或F-细胞。
噬菌体颗粒的大小是受其DNA的大小制约的(正好与λ噬菌体相反),因此它不存在包装限制问题。;M13噬菌体;构建M13噬菌体克隆载体的策略和途径;噬菌粒载体(phagemid vector);噬菌体;pUC119(MCS);噬菌粒载体的特点;CaMV(花椰菜花叶病毒)载体系统:双链DNA病毒
TMV(烟草花叶病毒)载体系统:单链RNA病毒
其他植物病毒载体系统,如单链DNA病毒:番茄金黄花叶病毒、非洲木薯花叶病毒、玉米线条病毒、小麦矮缩病毒,以及RNA病毒:雀麦草花叶病毒、大麦条纹花叶病毒、
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