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ICS 65.020.01
B 05
中 华 人 民 共 和 国 农 业 行 业 标 准
NY/T 3639—2020
中华猕猴桃品种鉴定 SSR 分子标记法
Identification of Actinidia chinensis cultivars using SSR markers method
2020-07-27发布
2020-11-01实施
中华人民共和国农业农村部发布
NY/T 3639—2020
目 次
前言 Ⅱ
1 范围 1
2 规范性引用文件 1
3 术语和定义 1
4 原 理 1
5 仪器设备及试剂 1
6 溶液配制 1
7 引物相关信息及使用 1
8 参照品种及其使用 1
9 操作程序 2
10 判定方法 4
附录A(规范性附录)主要仪器设备及试剂 5
附录B(规范性附录)溶液配制 7
附录C(规范性附录)核心引物名单及序列 9
附录D(资料性附录) 核心引物相关信息 10
附录E(资料性附录) 参照品种名单及来源 11
工
Ⅱ
NY/T 3639—2020
前 言
本标准按照GB/T1.1—2009 给出的规则起草。
本标准由农业农村部种业管理司提出。
本标准由全国植物新品种测试标准化技术委员会(SAC/TC 277)归口。
本标准起草单位:中国农业科学院郑州果树研究所、湖北省农业科学院果树茶叶研究所、天津市林业 果树研究所、十堰市经济作物研究所。
本标准主要起草人:方金豹、钟云鹏、齐秀娟、孙雷明、张蕾、林苗苗、刘景超、陈锦永、朱先波、顾红。
1
NY/T 3639—2020
中华猕猴桃品种鉴定 SSR 分子标记法
1 范围
本标准规定了利用简单重复序列(Simple Scquence Repeats,SSR)分子标记进行中华猕猴桃[Actin- idia chinensis Planchon,包括中华猕猴桃原变种(Actinidia chinensis Planch. var. chinensis)和美味猕猴 桃变种(Actinidia chinensis Planch. var. deliciosa A.Chevalier)]雌性品种鉴定的术语和定义、原理、仪 器设备及试剂、溶液配制、引物相关信息及使用、参照品种及其使用、操作程序和判定方法。
本标准适用于中华猕猴桃雌性品种的 SSR 分子标记鉴定。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
NY/T 2351 植物新品种特异性、 一致性和稳定性测试指南 猕猴桃属
NY/T 2594 植物品种鉴定 DNA 分子标记法 总则
3 术语和定义
NY/T 2594 界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1
核心引物 core primers
品种鉴定中优先选用的一套 SSR 引物,具有多态性高、重复性好等综合特性。
3.2
待测样品 test sample
送检单位提供的待鉴定的中华猕猴桃种质、品系、品种。
4 原理
简单重复序列(SSR) 广泛分布于中华猕猴桃基因组中,不同品种间每个 SSR 位点重复单位的数量可 能不同。针对每个SSR 位点两侧序列高度保守的特点,设计一对特异引物,利用 PCR (聚合酶链式反应, Polymerase chain reaction)技术对重复序列进行扩增。在电泳过程中,由于SSR 位点重复单位的数量不 同,经过扩增产生不同长度的片段,在电场作用下得到分离,经硝酸银染色或者荧光染料标记加以区分。 因此,根据SSR 位点的多态性,利用 PCR 扩增和电泳技术可以鉴定中华猕猴桃品种。
5 仪器设备及试剂
见附录 A。
6 溶液配制
见附录 B。
7 引物相关信息及使用
引物名单及序列见附录C, 引物等位变异等相关信息参见附录D。
8 参照品种及其使用
参照品种的名称及来源参见附录 E。 在进行待测样品等位变异检测时,应同时包括相应参照品种的
2
NY/T 3639—2020
PCR 扩增产物的检测。
注1:同一名称不同来源的参照品种的某一位点上的等位变异可能不相同,在使用其他来源的参照品种时,应与原参照 品种核对,确认无误后使用。
注2:对于附录E 中未包括的等位变异,应按本标准方法,通过使用DNA 分析仪与参照品种同时进行检测确定其大小。
9 操作程序
9.1 样品制备
试验样品为中华猕猴桃的幼嫩叶片,每份样品中至少随机抽取3个单株,进行混样分析。当一致性结 果较差时,进行单独取样分析。
9.2 DNA 提取
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