分子标记辅助育种--前沿讲座.pptVIP

（一）、多重PCR法 技术原理：即利用多对引物在同一反应条件下同时进行PCR扩增。 应用条件： 多个以PCR反应为基础的分子标记与目标性状紧密连锁； 各个分子标记的扩增产物具有不同分子量大小； 各引物的复性温度必须相匹配； Taq酶量与一个引物用量必须相同。 优点：降低成本，节约筛选时间，提高选择效率。 * 目前一百二十七页\总数一百七十六页\编于十九点 玉米温敏核雄性不育系琼68的育性受一对隐性基因控制 琼68 × K12 琼68 × F1 BC1 F2 可育：不育 1：1 3：1 umc1185 phi083 17.5 nc133 14.9 umc2380 7.7 umc1560 12.4 umc1497 6.1 umc2402 3.1 umc2129 4.6 TM3/tm3 3.7 umc1042 1.5 phi2513 7.7 bnlg1329 3.5 bnlg1520 4.7 phi328189 12.4 umc1947 7.9 umc1525 24.9 bnlg2077 11.2 bnlg1893 5.7 phi101049 16.3 phi039 23.0 玉米温敏核雄性不育基因TMS3/tms3的遗传连锁图 * 目前九十五页\总数一百七十六页\编于十九点 质量性状基因的精细定位—— NILs法 * 目前九十六页\总数一百七十六页\编于十九点 Cms-El（rf4rf4）×Cms-El(Rf4Rf4) 恢复基因Rf4的精细定位 Cms-C(rf4rf4)×Cms-C(Rf4rf4) ? BC1 1 Cms-C(Rf4rf4) 1 Cms-C(rf4rf4) 10000株分离群体 利用87-1背景的恢复基因Rf4的NILs * 目前九十七页\总数一百七十六页\编于十九点 (二)、数量性状基因的定位 大多数重要的农艺性状均表现为数量性状的遗传特点, 如产量性状、 成熟期、品质、抗旱性等。这类性状受多基因位点(Quantitative Trait Loci，QTL)和环境共同决定的 * 目前九十八页\总数一百七十六页\编于十九点 QTL定位是通过数量性状观察值与标记间的关联分析，即当标记与特定性状连锁时，不同标记基因型个体的表现值存在差异，来确定各个数量性状位点在染色体的位置、效应，甚至各个QTL间的相互作用。 * 目前九十九页\总数一百七十六页\编于十九点 QTL定位方法 根据个体分组依据不同，将QTL定位方法分成两类： 基于性状的分析法。 基于标记的分析方法。 * 目前一百页\总数一百七十六页\编于十九点 1.基于性状的分析法 将分离群体按某一数量性状表现型值分为两个极端组，如果一个标记与QTL连锁，那么该标记与QTL间会发生一定程度的共分离，其基因型分离比例在两组中都会偏离孟德尔规律，通过卡平方测验可以推断该标记是否与QTL连锁。该方法的缺点是只能用于单个性状的QTL定位，且灵敏度和精确度均较低，一般只对效应较大的QTL有效。 * 目前一百零一页\总数一百七十六页\编于十九点 2.基于标记的分析方法 如果某标记与QTL连锁，分离群体中该标记与QTL间会发生一定程度的共分离，那么，该标记的不同基因型数量性状表现型值会出现差异，即可推测该标记与QTL的连锁关系。其主要的代表性模型包括：单标记分析法、区间作图法等 * 目前一百零二页\总数一百七十六页\编于十九点 单标记分析法 通过t测验、方差分析、回归分析、似然比测验或最大似然估计，比较某一标记不同基因型数量性状表现型均值间的差异，如果差异显著，则说明控制数量性状的QTL与该标记连锁，进而估算其效应 前三种方法只能检测标记是否与QTL连锁，却无法估计它们间的重组率。 最大似然法虽然可以把参数估计和连锁检测合为一体，但存在以下几个缺点：不能确定标记是与一个QTL还是与几个QTL连锁；无法估计QTL的可能位置；由于遗传效应与重组率混合在一起，导致QTL效应值的偏估计；容易出现假阳性，且检测效率不高。 单标记分析法的优点是不需要完整的标记连锁图。 * 目前一百零三页\总数一百七十六页\编于十九点 区间作图法： 建立在个体数量性状观测值与双测标记基因型变量的线性模型的基础上的一种QTL定位方法，它利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL进行似然比检测，进而获得其效应的极大似然估计 缺点是需要构建分子标记连锁图 * 目前一百零四页\总数一百七十六页\编于十九点 示例 1 * 目前一百零五页\总数一百七十六页\编于十九点 示例 2 * 目前一百零六页\总数一百七十六页\编于十九点 * 目前一百零七页\总数一百七十六页\编于十九点 复合区间