［染色体］（5）染色体核型、微阵列、高通量测序、FISH等检测手段的具体区别.pdfVIP

［［染染⾊⾊体体］］ （（5））染染⾊⾊体体核核型型、、微微阵阵列列、、⾼⾼通通量量测测序序、、FISH等等检检测测⼿⼿段段的的具具体体 区区别别 临床意义 序: 随 现代检测技术⼿段的不断推陈出新，很多染⾊体病、基因病都逐渐得到了确认。对⼀些 遗传致病基因不但可以通过先进⼿段检测出来，也可以通过产前筛查及基因阻断技术成就⼀个 家族后代健康的梦想。 王桂芹 ⼤连美林达妇⼉医院 吕⽼师，有时间时可以⾔简意赅的给我们临床医⽣解释⼀下染⾊体核型、⼆代测序、基因芯 ⽚、⾼通量测序、微阵列、FISH等检测⼿段的具体区别吗？我们弄清楚了才能给患者更准确的 建议。⾮常感谢！ 吕远 遗传学博⼠中国医科⼤学盛博⼠后 现在的检测⼿段有染⾊体核型分析、⾼通量 测序 （⼆代测序）、微阵列 （基因芯⽚）、 FISH这⼏种检测⽅法，现在进⾏简单的介绍： 1. 染⾊体核型⼀般⽤来检测染⾊体的数⽬和⼤结构异常，⽐如13、18、21三体及性染⾊体异 常，或者超声提⽰畸形的胎⼉做个染⾊体核型，排除⼀下，还是⾦标准。 2.⾼通量测序也称⼆代测序。⾼通量测序主要⽤来检测单基因病基因突变位点和染⾊体的微缺失 微重复。检测基因位点和染⾊体使⽤不同的试剂盒及测序深度，分析⽅法也不相同。 3. 微阵列分析也称基因芯⽚。这个基因芯⽚主要是检测染⾊体⽔平的异常，很多⼈容易把它和 检测基因突变位点的测序弄混。⽬前，基因芯⽚主要就是检测染⾊体的微缺失微重复。成本⽐ ⾼通量测序贵，但是可以检测⾼通量测序不能检测出的单亲⼆倍体。 4. 任何组织(只要能提取到DNA)都可以做测序或芯⽚。所以当我们没有活的细胞⽤来培养时， 可以做这两种检测。绒⽑组织可以培养然后进⾏核型分析，但是失败率很⾼。做芯⽚或测序是 ⾮常⽅便快速的。 5. FISH理论上是可以检测基因组中任何位置的信息，但是需要相应的探针。⽬前临床常⽤的就 是13、18、21、X、Y染⾊体的检测试剂盒。主要⽤于快速产前诊断胎⼉常见染⾊体(13、18、 21、X、Y)的⾮整倍体异常。FISH检测需要依靠相应位置的探针。因此不常见的位置和变异不 太容易做，⽽且实验⽅法操作需要丰富的经验。湘雅有FISH的探针库，探针全，并且检测技术 ⾮常好。如果有特殊的位置需要做，我个⼈认为可以把⽚⼦寄过去做。FISH其实现在⽤的⾮常 少，它是⼀种芯⽚的验证⽅法，确认芯⽚的结果。 相关专家共识 微阵列分析或者基因芯⽚检测⽬前已经有专家共识了，它是核型分析⾮常好的补充。 吕远 遗传学博⼠中国医科⼤学盛博⼠后 针对基因芯⽚和⾼通量测序，我举个我遇到的实例，两个胎⼉：⼀个是⽣长受限，⼩于正常孕 周4周多；⼀个是四肢短⼩，但是双顶径符合孕周。第⼀个做了染⾊体微阵列分析，检测结果提 ⽰胎⼉15号染⾊体缺失了⼀⼩段，⽗母验证后⽆此⽚段缺失，该缺失⽚段⼩于核型的分辨率； 第⼆个做的是基因测序，结果提⽰是软⾻发育不良，FGFR3基因突变，⼀种典型的单基因遗传 病。两个胎⼉从超声提⽰上来看都是胎⼉的⾻长⼩于孕周，但并不是同⼀种问题。 ⼀般来讲单纯的某个组织或器官异常和畸形，考虑基因问题 （单基因突变导致的综合征），⽐ 如单纯的⾻骼畸形、先⼼病、多囊肾、多指、脑回畸形。 如果是多器官组织的异常⼀般考虑染⾊体的问题和单基因病中的综合征，⽐如21三体综合征， 表现为智⼒落后，特殊⾯容，⽣长发育障碍和多发畸形，并且症状轻重不⼀。染⾊体某段微⼩ 缺失重复的发病机理就是：⼀段染⾊体上涉及的基因⼀般都不是⼀个，⽽是⼏个甚⾄更多。每 个基因都有不同的功能，所以引起的症状⼀般也是多发畸形。单基因病导致的综合征通常具有 典型的临床表现，这个需要具体分析讨论。 总之，临床上见的畸形和疾病各种各样，不能⼀概⽽论，最好的办法肯定是染⾊体核型、染⾊ 体微缺失微重复及基因突变检测都筛查⼀遍，探寻异常。但是⽬前成本很⾼，并且典型的疾病 ⼀般通过临床症状就可以初步判断出来是染⾊体病还是单基因病。因此在选择检测⽅法上可以 有先后顺序。 王桂芹 ⼤连美林达妇⼉医院 那我说⼀下我的理解，染⾊体核型是检测染⾊体结构数⽬的异常。微阵列 （基因芯⽚）是检查 染⾊体的微缺失微重复，基因测序是针对单基因病的检测。 吕远 遗传学博⼠中国医科⼤学盛博⼠后 说了好多，可能还是很乱，我觉得在实践中应⽤过后才能理解的更透彻。不妨拿出临床上遇到 的畸形⼤家讨论⼀下。⽐如之前的独眼⽆脑畸形，45XX ，rob （13 ；14）。 王桂芹 ⼤连美林达妇⼉医院 这个罗伯逊易位查核型