理学晶体学课程.pptxVIP

理学晶体学课程;一、几何晶体学; 1.点阵结构及晶胞;晶体的点阵结构;晶胞和晶格;晶面指标;晶面指标;晶面指标;2.最基本的对称元素;旋转操作n―――旋转轴Ln;旋转轴—— 1.2.3.4.6重轴;镜面m和倒反操作i;旋转反演操作―――反轴Lin;基本对称元素名称，矩阵表达式及其等效点表;3.七个晶系;七个晶系及其特征对称元素;4.32个点群;第18页/共91页;;5.14个布拉菲格子;素晶胞（简单晶胞）和复晶胞;简单三斜aP 简单单斜mP 底心单斜mC(mA,mB) 简单正交oP C心正交oC(oA.oB) 体心正交oI 面心正交oF ;R心六方hR 棱方hP 简单四方tP 体心四方tI 简单立方cP 体心立方cI 面心立方cF ;6.230个空间群;螺旋旋转操作―――螺旋轴nm;螺旋旋转操作―――螺旋轴nm;反映滑移操作―――滑移面g;;第29页/共91页;第30页/共91页;第31页/共91页;;;;二、X射线晶体学;Bragg定律;2dhklsin? =n? 对某一晶体来说dhkl是确定不变的，当?一定时只有特定的?值才能满足以上方程，也就是说只有晶体处于某一方位时才能产生衍射。;第38页/共91页;1.倒易点阵;2.11个劳埃群;3.120个衍射群; system absence of lattic type condition Bravie lattic all hkl 1. h+k+l=2n I 2. h+k=2n h,k,l h+l=2n or all odd F k+l=2n all even 3. h+k=2n C (h+l=2n) (B) (k+l=2n) (A) 4. -h+k+l+3n R ;三、晶体结构测定;1.相角问题;;2.Patterson法(1)Patterson函数;(2)Patterson峰的特性;3)Patterson法解结构一般步骤;3.直接法简介;四、蛋白质晶体学;4.1 蛋白质分子与小分子差别;4.2蛋白质晶体结构测定基本步骤;4.3结晶4.3.1结晶过程相图;4.3.2影响结晶的因素;4.3.3结晶方法;4.4数据收集与处理4.4.1历史发展;4.4.2数据收集时考虑的参数;;4.4.3数据收集中的一些技巧;4.4.4数据处理（Denzo程序）;;;;4.4.5数据质量评价;4.5相角测定;4.5.1多对同晶置换法;4.5.1.1重原子衍生物制备;4.5.1.2确定重原子位置;;4.5.1.3共同原点;4.5.1.4重原子参数的修正;4.5.1.5蛋白质相角;4.5.2分子置换法;4.5.2.1旋转函数;;4.5.2.2平移函数;4.5.3??波长反常散射法4.5.3.1反常散射确定蛋白质相角;4.5.3.2利用反常散射确定分子绝对构型;4.5.3.3多波长反常散射法应用前提;4.5.3.4多波长反常散射法基本原理;;4.6相角改进4.6.1溶剂平滑化;4.6.2分子平均;;4.7电子密度图的计算和解释;4.8结构修正4.8.1修正的目标;4.8.2立体化学制约的最小二乘法;;4.8.3分子动力学方法或模拟退火;4.8.4结构可靠性的检验;感谢观看!