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肠道菌群技术服务用户需求书 一、 委托检测内容 .宏基因组测序：粪便或血液样品 宏基因组研究以环境中所有微生物基因组为研究对象，通过对环境样品中的 全基因组DNA进行高通量测序，获得单个样品的饱和数据量，基于denovo组装 进行微生物群落结构多样性，微生物群体基因组成及功能，特定环境相关的代谢 通路等分析，从而进一步发掘和研究具有应用价值的基因及环境中微生物群落内 部、微生物与环境间的相互关系。构建的环境微生物基因集，可为环境中微生物 的研究、开发和利用提供基因资源库。质量合格的基因组DNA样品通过超声波 高性能样品处理系统(Covaris)随机打断，经过片段选择后得到300bp左右的 片段。加上接头，进行cluster制备，最后利用Paired-End的方法对插入片段 进行测序，得到的原始数据经过质控和数据过滤，宏基因组组装、基因预测、构 建参考基因集。 .宏转录组测序：粪便或血液样品 宏转录组是从整体水平上研究某一特定环境，特定时期群体生命全部基因组 转录情况以及转录调控规律，它以生态环境中的全部RNA为研究对象，避开了微 生物分离培养困难的问题，能有效的扩展微生物资源的利用空间。相较于宏基因 组，宏转录组能从转录水平研究复杂微生物群落变化，能更好的挖掘潜在的新基 因。 .宏蛋白组测序：粪便或血液样品 宏蛋白组学是应用蛋白组学技术对微生物群落进行研究的一项新技术，在特 定时间