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生物信息学资源第1页/共72页 2Questions:1. 蛋白质二级结构有哪些？2. TSS,外显子和内含子的概念。3. 如何判断起始密码子和终止密码子？内含子？第2页/共72页 3请画出示意图:1. 中心法则2. 真核生物基因的一般结构第3页/共72页 4核酸中心法则 复制 DNA 转录 逆转录 复制 RNA 蛋白质 翻译 调控第4页/共72页 5TATA盒 翻译起始植物C/GAANNATGG动物A/GNNATGG 各内含子加poly(A)信号植物 G/AATAA1-3动物 AATAAA 终止密码子 各个外显子 加帽位点 5m7GpppNp 5端 TSS 3端 AGGA或 CAAT盒 起始密码子 真核生物基因的结构：Promotor2000bpUTRUTR第5页/共72页 6转录翻译Promotor2000bpUTRUTR第6页/共72页 7编号名称第一章生物信息学引论第二章生物信息学的生物学基础第三章生物信息学数据库资源第四章DNA和蛋白质序列分析第五章系统发生分析第六章基因表达数据分析第七章其他常用生物信息学工具第八章电子克隆的原理和应用第九章基本生物信息学工具的开发与应用第7页/共72页 8第三章 生物信息学数据库资源第8页/共72页 9提纲:模式生物测序3大核酸数据库蛋白质数据库第9页/共72页 10提纲:模式生物测序3大核酸数据库蛋白质数据库第10页/共72页 11第11页/共72页 12humanArabidopsisThermotoga maritimaEscherichia coliBuchnerasp. APSRickettsia prowazekiiUreaplasma urealyticumBacillus subtilisDrosophila melanogasterThermoplasma acidophilumPlasmodium falciparumHelicobacter pylori mouseCaenorhabitis elegansratBorrelia burgorferiBorrelia burgorferiAquifex aeolicusNeisseria meningitidis Z2491Mycobacterium tuberculosis 一、模式生物第12页/共72页 13模式生物基因组计划模式生物基因组计划 酵母、线虫、果蝇、细菌、拟南芥、人类、水稻等共约50多种已完成，70余种正在进行。目前总量已达60亿碱基对！ 第13页/共72页 142001年2月15日《Nature》封面2001年2月16日《Science》封面第14页/共72页 15又一次成功！ ——水稻基因研究引言第15页/共72页 16我国自主产权的全基因组测序计划水稻 (2002)家鸡 (2004)家蚕 (2007)家猪 (2009)大熊猫 (2010)第16页/共72页 virusesplasmidsbacteriafungiplantsalgaeinsectsmollusksreptilesbirdsmammalsGenome sizes in nucleotide pairs (base-pairs)10410810510610710111010109bony fishamphibians第17页/共72页 18模式生物(Model Organism)病毒（Virus） 不具有细胞形态结构，仅由核酸和蛋白质构成； 如：人艾滋病毒HIV、SARS冠状病毒 体积小，10～300nm； 严格的专性细胞内寄生； 对抗生素不敏感。电子显微镜下的SARS冠状病毒100nm第18页/共72页 19Escherichia coli大肠杆菌大肠杆菌是研究得最为详尽的一个模式生物。这种只有1.6微米长的、可以迅速繁殖的单细胞原核生物，已经成为实验室和基因工程的重要工具。Escherichia coli O157:H7Escherichia coli K12模式生物(Model Organism)第19页/共72页 20Saccharomyces cerevisiae酿酒酵母真菌界的单细胞真核生物，它的全基因组已在1996年测定。模式生物(Model Organism)第20页/共72页 21秀丽线虫Caenorhabditis elegans一种透明的、生活在海滩泥沙中的小虫。 细胞数目一定：成虫细胞数目只有959个，其中包括302个神经元； 有6条染色体，全基因组于1998年测定，长9.7Mb模式生物(Model Organism)第21页/共72页 22Drosophila mel