RBM8A对乳腺癌的预后作用及与肿瘤免疫浸润的相关性.docxVIP

? ? RBM8A对乳腺癌的预后作用及与肿瘤免疫浸润的相关性 ? ? 李良平 冯 刚 欧阳理权 周雪华 姜 灿 张胜初 (三峡大学 第一临床医学院[宜昌市中心人民医院] 甲乳外科， 湖北 宜昌 443003) 国际癌症研究机构统计数据显示，2020年乳腺癌成为全球发病第一的肿瘤，约占所有肿瘤总数的11.8%，其根本原因之一是乳腺癌发病风险因素不断变化[1-2]。乳腺癌的治疗理念是个性化治疗以及基于肿瘤生物学和早期治疗反应的降级和升级治疗[3]。在分子水平上乳腺癌是一种异质性疾病，治疗策略因分子亚型而异，其发病机制非常复杂。因此，对乳腺癌发病机制的分子生物学研究有可能为乳腺癌的治疗及预后评估提供新的方向。 RNA结合蛋白8A(RBM8A，Y14)是RNA结合蛋白家族的一员，包含一个RNA结合基因序列，与Magoh形成紧密的异二聚体，是外显子连接复合体(exon-junction complex，EJC) RNA监视机制的核心结构[4-5]。RBM8A在mRNA代谢过程中如剪接、mRNA输出和无义介导mRNA降解中起重要作用。RBM8A与RNA转录、翻译、细胞周期调控和凋亡调控、DNA损伤修复密切相关[5-9]。研究表明RBM8A在各种渐进性神经系统疾病中发挥作用，RBM8A的低表达与自噬中关键复合物组件的减少可能在阿尔茨海默氏症(alzheimers disease，AD)病理生理变化中起到重要作用[10-11]。在遗传性疾病血小板减少伴桡骨缺失综合征中也观察到RBM8A基因的突变及异常表达[9,12-13]。同时，RBM8A在多种恶性肿瘤中也有异常表达。研究表明RBM8A在肝癌、胃癌、胶质细胞瘤中均促进肿瘤细胞增殖及侵袭[14-17]，但在乳腺癌中相关研究未见报道。 在本研究中，我们通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)和各种公共数据库研究了乳腺癌患者RBM8A的表达、突变以及与临床病理特征的关系，多维度分析乳腺癌中与RBM8A相关的基因改变、功能网络及相关作用机制，以期为乳腺癌的诊断和治疗提供新的靶点和策略。 1 材料和方法 1.1 RBM8A基因表达分析 RBM8A在泛癌中转录组水平表达通过TIMER数据库(https：//cistrome.shinyapps.io/timer/)、GEPIA数据库(/index.html)联合分析。通过UALCAN()分析TCGA数据(/)，探索RBM8A在乳腺癌组织和正常组织中的转录组表达水平及与临床特征之间关系，RBM8A在乳腺癌组织中蛋白表达通过HPA数据库()分析。 1.2 生存分析 Kaplan-Meier数据库(/analysis/)分析RBM8A在乳腺癌中生存曲线，通过PrognoScan数据库予以验证(http://dna00.bio.kyutech.ac.jp/PrognoScan/)。 1.3 RBM8A相关基因分析 本研究中使用LinkedOmics数据库(http://www.linkedomics)、cBioPortal、GEPIA综合分析RBM8A共表达基因，Pearsons相关系数对RBM8A共表达基因进行统计分析。 1.4 GO、KEGG分析 使用Metascape数据库(/gp/index.html#/main/step1)对RBM8A及共表达基因本体生物学过程(gene ontology，GO)、基因信号通路(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG)进行富集分析及蛋白网络分析，通过Cytoscape 3.8.2软件分析和鉴定互作蛋白中核心模块。 1.5 肿瘤免疫浸润相关性分析 TISIDB是评估肿瘤免疫系统相互作用的在线数据库(http://cis.hku.hk/TISIDB)。采用TISIDB来分析RBM8A和肿瘤浸润淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes，TILs)在乳腺癌中的表达相关性。在基因表达谱的基础上，利用基因集变异分析来推断TILs的相对丰度。Spearman分析RBM8A与TILs之间的相关性。 1.6 统计学方法 RBM8A表达水平不同组间差异采用两独立样本t检验或多组间两两比较的Dunnett-t检验，P 2 结果 2.1 RBM8A在泛癌中的表达 通过TIMER及GEPIA数据库研究RBM8A在各类恶性肿瘤中转录组表达水平，结果显示RBM8A在膀胱癌、乳腺癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食管癌、头颈鳞状细胞癌、肾癌、肝细胞肝癌、肺癌、胃癌、甲状腺癌、皮肤黑色素瘤、子宫内膜癌中升高，差异均有统计学意义(均P0.05)，在前列腺癌、直肠癌中无差异表达，其中在肾嫌色细胞癌、甲状腺癌中RBM8A表达量下降(P0.0