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基于竞争包合的液晶传感分子工作原理研究
该算法易于操作,能耗低,具有特殊的光学放大效果,适合其他类型的检测技术。与其他类型的检测技术相比,该算法易于操作,因此其业务领域非常广阔。然而, 在目前的液晶传感器研究工作中, 所涉及的待测物质种类很局限, 一类为有机胺、有机磷气体分子, 另外一类为生物活性大分子。
丰富的液晶传感器器件结构形式的发展, 尽管为高性能的液晶传感器的发展奠定基础, 但实现液晶传感器对更多物质的检测的研究将会带来更大的商业与科研价值。2014年, 左芳教授提出了基于对超分子竞争包合的液晶传感器为开发更多检测对象提供了思路
尽管具有超分子竞争包合的液晶传感器大大开阔了待测分子的设计思路, 但单单从实验出发进行传感器的设计方面的探索, 成本很高。计算科学的发展无论是在理论上还是在实验上都使原有的材料研究手段得以极大的改观。而本课题组在实验的基础上, 通过理论计算模拟本课题组提出的液晶传感器的环糊精竞争包合作用, 不仅与实验相符, 也成功验证了多巴胺无法被检测
1 界面原始模型的构建
本文建模和计算均是在Accelrys公司的Materials Studio 8.0这个平台上进行的
1) 5CB//真空界面:首先构建了含有80个已优化5CB分子的36×18×53无序晶胞, 随后沿着Z轴方向加上100?的真空层, 得到了5CB/真空界面原始模型;对模型依次进行构优化, 10ps NVE 和1ns NVT计算, 最后分析结果。
2) 5CB/水界面:构建水相部分时, 在满足计算限制的条件下, 溶剂水数量控制在NVT动力学 模拟过程不会挥发到真空相中。由此, 我们先构建含有1800个H
3) SDS/水界面:考虑到表面活性剂在刚刚挤满一层的时, 表面效应最佳, 这里的表面活性剂只够建了一层。先构建含有18个SDS阴离子平行放置的36×18×20有序的晶胞;再构建含有1800个H
4) 5CB/SDS/水界面:构建三层结构, 分别为动力学模拟后的SDS/水界面的晶胞、动力学模拟后5CB/水界面模块去掉水后的5CB层和真空层, 仍然依次进行结构优化, 10ps NVE和2ns NVT计算, 分析结果。
2 结果和讨论
2.1 评估的结果与分析
观察5CB/真空界面, 如图1所示, (a) 为MS最初构建的5CB/真空界面原始模型, 分子取向整体上无序。 (b) 是经过1ns NVT计算的分子动力学模拟结果。从中可以看出体系初始结构排列杂乱无章, 没有次序。动力学模拟后, 5CB分子靠得更加紧密, 且分布得更加均匀, 5CB分子取向均转水平, 整体上分子趋于逐渐趋于一维有序但氰基的分布不具有规律性。从分子间作用力的角度看, 这主要因为5CB的中芳香环之间的色散作用
然后, 观察5CB水的作用界面, 图2中的 (a) 为取上一步一维有序的取向5CB原始模型与水接触构建的有效界面。 (b) 和 (c) 分别为分子动力学模拟1ns和2ns的NVT计算结果。对比 (a) , (b) 和 (c) , 可以发现水和5CB作用时液晶5CB分子取向翻转, 转向与水的界面平行, 而正是这种取向的转变, 导致5CB在水溶液中的偏振光发生改变, 与实验相符。
为了进一步了解液晶5CB分子取向的特征, 我们统计了1ns和2ns计算结果模型中氰基上的氮原子到水分子中氢原子的距离小于3.5?距离径向分布和5CB分子中联苯质心到水分子中氧原子距离小于4?距离的径向分布。结果显示, 图3 (a) 中1ns内联苯质心到氧原子的最近距离为3.19?; (b) 图中2ns内最近距离为2.97?。最近距离变小说明在动力学计算过程中, 5CB分子在靠近水分子。并且苯质心和与水的氧原子距离在3.0以内, 说明形成了有效的范德华力, 验证了水界面附近的5CB分子取向发生翻转逐接近于水平。同时把 (b) 与 (a) 相比较, 2ns内峰变多, 峰变得更高, 说明随着分子动力学计算的进行, 翻转的5CB分子越多, 且翻转的趋势越大。主要驱动原因在于芳香环上苯电子云离域所产生的色散力大, 翻转的分子越多, 联苯靠水界面越近, 色散力越强体系越稳定。另一方面, 从氰基上的氮原子到水分子中氢原子距离的径向分布图 (a) 和 (b) 均可以观察到在2?左右看到更大的极值峰, 这说明氰基与到水分子中氢原子形成了有效的氢键。比较 (c) 和 (d) , 可以发现在 (d) 图中分布2.0?左右的峰的变多, 这说明氰基与水分子形成的氢键数量变多了, 进一步证明取向在近一步发生转变。再结合界面作用的放大图可以发现, 5CB晶体分子趋于有氰基的极性一端和极性相互聚拢, 非极性的烷基端相互靠拢, 主要根源应该是界面氢键导致的。
2.2 抗滑桩界面模拟
SDS作为液晶传感器的传感分子, 它和5C
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