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微生物实验论文
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产淀粉酶细菌的筛选和选育
陆 芸
(南京师范大学生命科学学院 09级3班
【摘要】分子特征的鉴定主要以16SrDNA 序列分析的方式进行,16SrDNA 是编码原核生物核糖体RNA小亚基16SrRNA 的基因,与细菌整个基因组的变化相比,它具有高度的保守性,其变化的概率与细菌的变异和进化程度是一致的,所以有助于细菌的鉴定和分类。结合完善的数据库,16SrDNA 序列分析可以快速准确的对细菌进行种属鉴定。
【关键词】产淀粉细菌,分离,筛选,紫外诱变
土壤是微生物的大本营,微生物资源的寻找和筛选工作常将土壤作为样品采集的首选地。本实验采集了南京师范大学北去食堂后的土壤样本,通过培养基制备及灭菌、菌种的分离纯化、菌种的鉴定、培养条件的优化以及诱变育种等过程,旨在发掘利用微生物资源,筛选并选育产淀粉酶细菌。
土壤微生物种类繁多,对于采集培养的细菌通常进行生物学鉴定。除通常用的形态学方法外,分子特征的鉴定主要以16SrDNA 序列分析的方式进行,16SrDNA 是编码原核生物核糖体RNA小亚基16SrRNA 的基因,与细菌整个基因组的变化相比,它具有高度的保守性,其变化的概率与细菌的变异和进化程度是一致的,所以有助于细菌的鉴定和分类。结合完善的数据库,16SrDNA 序列分析可以快速准确的对细菌进行种属鉴定。
紫外线是最常用的一种物理诱变因素,对诱变最有效的波长是在253-265nm。紫外线具有致死和诱变的双重效应。紫外线照射引起的DNA损伤,可由细胞内的光复活酶的作用进行修复。因此用紫外线照射处理时以及处理后的操作应该在红光下进行,并且将照射处理后的微生物置于暗处培养。
一、实验材料与方法
1.实验仪器和材料
仪器:全自动高压蒸汽灭菌釜,手提式高压蒸汽灭菌釜,电子台秤,普通天平,无菌离心管,摇床,分光光度计,凝胶电泳仪,水平电泳槽,紫外检测灯,PCR管,PCR仪,微量移液枪,枪头,超净工作台,脱色摇床,台式高速离心机
试剂:摇瓶发酵培养基相关的化学药品、试剂与原料、1N的NaOH和HCl,
配制牛肉膏蛋白胨培养基,革兰氏染色全套试剂, PCR反应试剂,琼脂糖,溴化乙锭,TAE电泳缓冲液
2.实验步骤
2.1 培养基配制
2.1.1牛肉膏蛋白胨培养基的配制
配方(g/L):牛肉膏 3,蛋白胨 10,NaCl 5,琼脂 20,pH7.0~7.2
2.1.2无菌水的准备
2.1.3 灭菌材料与器皿的包扎
2.2 土壤样品的采集并制备土壤稀释液
称取土壤2g,放入18mL带有玻璃珠的无菌水三角瓶中,振荡5min,即为稀释10-1的土壤悬液。然后在离心管中依次稀释至10-2 、10-3 稀释度。
2.3 制备淀粉培养基、平板并涂布、划线平板分离、培养鉴定
2.3.1制5块含1%可溶性淀粉的牛膏蛋胨培养基平板
2.3.2涂布平板分离、划线平板分离
无菌操作法分别吸取0.1 mL 10-2 、10-3土壤稀释液及80℃加热的10-2 的土壤悬液,分别加在已制好的淀粉平板培养基上,将稀释液在培养机上充分混匀铺平,
取10-1 的土壤悬液在平板上划线。30℃恒温箱培养,培养24小时。
2.3.3鉴定
先将单个菌落用记号笔标号,将标记的单菌落用灭菌牙签划线接种到另一新鲜平板上,记下相应标号,30℃培养备用。然后打开平板,倾斜倒入碘液,快速放平,5分 钟后观察显色斑点,观察产水解斑的菌落并记录水解斑的大小。
2.4 产淀粉酶细菌培养
对照分离平板上菌落的水解圈大小,挑取水解圈最大一个菌苔,在淀粉培养基平板上进行划线分离,进一步纯化菌株
2.5 不同营养和培养条件
2.5.1菌种活化与培养
提前24h平板菌种接液体试管活化,并接种一支斜面试管保藏
2.5.2发酵液接种
提前3h按0.5%接种量分别转接如下五种液体摇瓶发酵培养基。
2.5.3菌体生长量的测定
将培养18h后液体摇瓶培养物分别取出3mL于比色杯中,在721型分光光度计600nm波长下测定吸光值(optical density,OD600值)。 分别记录各种不同培养基和不同培养条件下OD600值大小,评价对菌体生长量的影响。
2.6 产淀粉酶待检菌形态特征鉴定
培养特征的观察、细菌细胞的显微观察、细菌的革兰氏染色
2.7 细菌的16S rRNA分子鉴定
用灭菌牙签挑取单菌落于20 ul PCR管中,加热10min,离心2min。在一个PCR管中用微量移液枪加入混合液20ul,和5 ul菌液,置于冰上备用。震荡,将菌体和反应体
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