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ICS 07.080
B41
福 建
省 地
DB35
方 标 准
DB35/T 1327—2013
番鸭呼肠孤病毒 RT-PCR 检测方法
2013 - 02 - 20 发布
2013 - 05 - 20 实施
福建省质量技术监督局 发 布
I
DB35/T 1327—2013
目 次
前言 II
1 范围 1
2 规范性引用文件 1
3 方法原理 1
4 实验室准备 1
5 实验室条件 2
6 操作程序 2
7 分析判定 2
8 样品无害化处理 3
附录 A(规范性附录) 试剂的配制 4
附录 B(资料性附录) 番鸭呼肠孤病毒 S1 基因序列 6
参考文献 7
II
DB35/T 1327—2013
前 言
本标准按照 GB/T 1.1-2009《标准化工作导则 第 1 部分:标准的结构和编写》给出的规则编写。 本标准由福建省农业厅提出并归口。
本标准由福建省农业科学院畜牧兽医研究所负责起草。
本标准主要起草人: 林锋强, 陈少莺, 胡奇林, 陈仕龙, 王劭, 程晓霞, 朱小丽, 李兆龙, 黄冬菊, 陈建翊。
1
DB35/T 1327—2013
番鸭呼肠孤病毒 RT-PCR 检测方法
1 范围
本标准规定了应用 RT-PCR 方法检测番鸭呼肠孤病毒的材料准备、操作方法、结果判定及样品无害 化处理。
本标准适用于番鸭呼肠孤病毒的检测。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件, 仅注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 6682-2008 分析实验室用水规格和试验方法
3 方法原理
将番鸭呼肠孤病毒RNA基因逆转录为互补DNA,以此为模板,利用番鸭呼肠孤病毒(muscovy duck reovirus, MDRV) S1基因序列(见附录B) 设计的一对引物,进行PCR特异性扩增, 扩增与预期大小300bp 相符的片段,对病毒核酸进行定性。
4 实验室准备
4.1
微量移液器
4.2
高速冷冻离心机
4.3
聚合酶链式反应仪
4.4
电泳仪
4.5
凝胶成像系统
4.6
PBS(0.01mol/L pH7.2)
配制方法按附录 A 中 A.2 进行。
4.7 TRIzol 试剂
4.8 三氯甲烷(分析纯)
4.9 异丙醇(分析纯)
4.10 无水乙醇(分析纯)
4.11 50×TAE 缓冲液
配制方法按附录 A 中 A.3 进行。
2
DB35/T 1327—2013
4.12 电泳级琼脂糖
配制方法按附录 A 中 A.4 进行。
4.13 AMV 反转录酶
4.14 RNA 酶抑制剂
4.15 Taq DNA 聚合酶
4.16 SYBR 荧光染料
配制方法按附录 A 中 A.5 进行。
4.17 上样缓冲液
配制方法按附录 A 中 A.6 进行。
4.18 灭菌双蒸馏水
配制方法按附录 A 中 A.7 进行。
4.19 MgCl2 溶液
4.20 5×反转录反应缓冲液
配制方法按附录 A 中 A.8 进行。
4.21 Random 9mers
配制方法按附录 A 中 A.9 进行。
4.22 2.5mmoL dNTPs
配制方法按附录 A 中 A.10 进行。
4.23 10×PCR Buffer
配制方法按附录 A 中 A.11 进行。
4.24 引物
配制方法按附录 A 中 A.12 进行。
4.25 DNA 分子量标准(DL2000)
4.26 MDRV 细胞毒
配制方法按附录 A 中 A.13 进行。
注:建议使用经验证有效的商品化核酸提取、反转录、聚合酶链式反应试剂盒,配合本标准开展 RT-PCR 检测。
5 实验室条件
RT-PCR 实验室应划分出 RNA 提取区、基因扩增区、电泳区。
6 操作程序
6.1 样品的采集和处理
无菌采集病鸭或病鹅的样品(肝、脾、血液、分泌物或排泄物等),加无菌 PBS (0.01mol/L pH7.2) 制成 10%悬液,冻融 3 次, 3000 g 离心 20min,取上清液,待提取 RNA 。1)
1) 检测后的样品应进行高压消毒无害化处理。
3
DB35/T 1327—2013
6.2 实验对照
设立阳性对照、阴性对照。
6.3 RNA 的提取
每个样品取250μL上清液加入750μLTRIzol试剂, 反复摇匀; 室温(15℃~30℃) 放置5min; 加入 150μL氯仿, 剧烈振荡15s,室温放置3 min;2℃~8℃10000 g离心
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