《结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识》(2021)主要内容 .pdfVIP

《结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识》（2021 ）主要内容 结直肠癌在我国的发病率呈逐年上升的趋势，世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC) 数据显示，我国 2020 年结直肠癌的新发病例数为 56 万例，因结直肠癌死亡病例达 29 万例。约 25%的结直肠癌患者在诊断时已出现远处转移，此外，25%的患者在治疗过程中 发生转移，晚期患者预后较差，5 年生存率不足 15%。分子标志物检测是筛选靶向治疗获 益人群的前提，近年来随着检测技术的飞速发展，高通量测序，也称为下一代测序(NGS) ， 因其在通量、成本及效率等方面的综合优势，在肿瘤基因突变检测中展现出越来越广阔的 应用前景。然而 NGS 检测技术流程复杂 ，对实验室环境条件、人员能力及质量管理要求 高，任何一个环节出现问题 ，均会影响检测结果的准确性 ，进而影响临床决策。 1 生物标志物在结直肠癌中的临床意义 1.1 结直肠癌诊疗必须/可选检测的生物标志物 结直肠癌诊疗的相关生物标志物具体见表 1。 1.2 遗传性结直肠癌相关检测 目前较明确的肠癌相关遗传性疾病主要有 3 类： Lynch 综合征、家族性腺瘤性息肉 病(FAP) 和黑斑息肉病(P-J 综合征)。遗传性结直肠癌筛查和基因诊断原则可参考《中国临 床肿瘤学会( CSCO) 结直肠癌诊疗指南 2020 版》。见表 2。 需要强调的是，MMR/MSI 检测是 Lynch 综合征的筛查手段 ，Lynch 综合征的确诊有 赖于基因测序。FAP 推荐进行 APC 外显子测序/片段缺失测序，有突变提示 FAP 或衰减型 FAP(AFAP) ；无突变则推荐行 MUTYH 外显子测序/片段缺失测序，有突变提示 MUTYH 相关息肉病(MAP) 。 1.3 结直肠癌中常见 TMB 判读方法及检测范围汇 总 TMB 检测有助于帮助筛选免疫治疗潜在获益的患者，显著提升晚期恶性肿瘤患者 的客观缓解率和总生存 期。 MSI-H/dMMR 通常也伴随 TMB-H ，MSI-H 肿瘤样本中有 约 83%表现 为 TMB-H ，且有97%的样本 TMB ≥10 Muts/Mb。 在临床研究和实践过程中，TMB 的评估判读标准在不同癌种中存在差异，而不同靶向 测序 Panel 的 TMB 检测体系之间 TMB 阈值不能通用。表格中收集了目前市场上部分检测 公司的 TMB 判读方法及检测信息(表 3) ，为临床医师综合判断TMB 标准提供参考。 1.4 生物标志物时机及检测内容 根据结直肠癌患者制定相关治疗方案的过程，结合结直肠癌生物标志物相关临床意义 ， 建议检测作如下推荐。 (1) ～期结直肠癌(表 4) ： 2 样本处理及转运 2.1 FFPE 样本 2.2 手术或活检的新鲜组织样本 2.3 血浆样本 2.4 样本运送规范 3 报告解读及标准模板 3.1 NGS 临床报告包含内容 3.2 基因变异的命名 3.3 临床意义的解读和批注 3.3.1 对于肿瘤体细胞突变，采用分级处理的方式 3.3.2 对胚系突变的检测 3.3.3 意义不明位点的处理 3.3.4 DPYD 检测结果 3.4 低丰度突变结果的处理 3.5 知情同意 3.6 报告模板 4 NGS 实验室建设的要求 4.1 人员资质 4.2 实验室环境及设备 4.3 试剂及耗材要求 4.4 明确结直肠癌分子检测的临床预期用途 4.5 NGS 方法学建立及其关键环节优化 4.6 性能验证或性能确认 4.7 室内质量控制 4.8 室间质量评价或能力验证