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- 2023-09-28 发布于上海
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大鼠大脑皮层发育的小RNA转录组研究的中期报告
本研究采用高通量测序技术分析大鼠大脑皮层不同时间点(E12.5,E14.5和E16.5)的小RNA转录组。经过质控和过滤,共获得了约1.2亿条有效测序序列。经miRDeep2软件分析,发现在三个时间点的小RNA中,miRNA是数量最多的一类,分别检测到了约400种miRNA。此外,还检测到了piRNA、tiRNA和snRNA等小RNA种类,但数量比miRNA少得多。
进一步比对发现,约80%的miRNA在三个时间点都有表达,其中约一半miRNA的表达量具有时相特异性。此外,在E12.5和E14.5的miRNA表达中有一些特异性差异,这表明miRNA可能在大脑皮层早期发育中发挥了重要的调控作用。
针对miRNA的靶基因预测分析发现,这些miRNA主要靶向与神经发育、突触功能和细胞分化等相关的信号通路。对一些关键miRNA的功能验证正在进行中。
综上所述,本研究初步揭示了大鼠大脑皮层发育过程中小RNA转录组的变化规律。未来还将进一步探究这些小RNA在大脑皮层神经发育中的功能和作用机理。
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