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《分子生物学精要》 基因组与比较基因组学 教学目的 掌握基因组学与比较基因组学的相关知识，了解人类基因组计划。 学习指导 本章首先介绍了基因组学的概念和分类，分为功能基因组学和结构基因组学。后介绍了比较基因组学的相关研究。最后介绍了人类基因组计划的内容。重点掌握基因组学与比较基因组学的概念，人类基因组计划的过程进展，基因测序的主要方法。 基本概念基因蛆(genome)指导一个生物物种的结构和功能的所有遗传信息的总和，包括全部的基因和调控元件等核酸分子。 基因组学(genomics)从整体水平上来研究一个物种的基因组的结构、功能及调控的一门科学。基因组学可分为结构基因组学和功能基因组学两大部分。 结构基因蛆学(structuralgenomics)通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。 功能基因蛆学(functionalgenomics)利用结构基因组学所提供的生物信息和材料，全基因组或全系统地理解某种生物的遗传体系，即阐明DNA序列的功能。 基因打靶(genetargeting)，这种技术是通过基因工程的方法将一个结构已知但功能未知的基因去除，或用其他序列相近的基因取代(又称基因敲入)，然后从整体观察实验动物，从而推测相应基因的功能。 比较基因蛆学(ComparativeGenomics)是基于基因组图谱和测序基础上，对已知的基因和基因组结构进行比较，来了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科。 人类基因组计划(humangenomeproject，HGP)于20世纪80年代提出的，由国际合作组织包括有美、英、日、中、德、法等国参加进行了人体基因作图，测定人体23对染色体由3X109核苷酸组成的全部DNA序列，于2000年完成了人类基因组“工作框架图”。2001年公布了人类基因组图谱及初步分析结果。其研究内容还包括创建计算机分析管理系统，检验相关的伦理、法律及社会问题，进而通过转录物组学和蛋白质组学等相关技术对基因表达谱、基因突变进行分析，可获得与疾病相关基因的信息。 本章主要内容第一节基因组与基因组学 由于分子生物学和分子遗传学理论及技术的发展，到20世纪末，科学家已有能力开始研究单个生物的全部遗传信息。这促使他们的研究工作从研究一个物种的单个基因或一群基因转向研究一个物种的所有基因即基因组，由此形成了基因组学。 一、基因组 基因组的概念 Winkler在1920年首次提出基因组（genome）一词，意为gene与chromosome的组合。目前在不同的学科中，对基因组含义的表述有所不同，概括为如下：①从细胞遗传学的角度来看，基因组是指一个生物物种单倍体的所有染色体数目的总和；②从经典遗传学的角度来看，基因组是一个生物物种的所有基因的总和；③从分子遗传学的角度来看，基因组是一个生物物种所有的不同核酸分子的总和；④从现代生物学的角度来看，基因组是指导一个生物物种的结构和功能的所有遗传信息的总和，包括全部的基因和调控元件等核酸分子。 基因组的大小和组成 不同生物基因组大小及复杂程度不同，具有物种差异性。一般来说，从原核生物到真核生物，其基因组大小和DNA含量是随着生物进化复杂程度的增加而逐步上升的。随着生物结构和功能复杂程度的增加，需要的基因数目和基因产物种类越多，因而基因组也越大。但不同生物的基因组间有一定的相关性，表现为基因特性的相似、结构及组成的雷同、遗传信息的传递方式及遗传密码的趋同性等。 动物基因组的主要成分是核基因组，它与细胞质分开。组成核基因组和线粒体基因组的序列形式与原核生物显著地不同，在不同物种中也有一些差异，有些序列是单拷贝的，而另一些序列是多拷贝的；另外还有大量的不编码蛋白质的DNA序列。 二、基因组学 基因组学（genomics）最初是由美国科学家ThomasRoderick于1986年提出的，当时其内容是指基因组作图（mapping）和测序（sequencing）。但后来随着人类基因组计划的进展，其含义得到了不断的发展和更新。于是，科学家们将它定义为研究生物基因组的结构和功能的科学，即从整体水平上来研究一个物种的基因组的结构、功能及调控的一门科学。基因组学可分为结构基因组学（structuralgenomics）和功能基因组学（functionalgenomics）两大部分。 结构基因组学 结构基因组学是基因组学的一个重要组成部分和研究领域，它是一门通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。遗传信息在染色体上，但染色体不能直接用来测序，必须将基因组这一巨大的研究对象进行分解，使之成为较易操作的小的结构区域，这个过程就是基因作图。根据使用的标志和手段不同，作图有三种类型，即构建生物体基因组高分辨率的遗传图谱、物理图谱、转录图谱。 基因组测序是结构基因组学最基本的研究工作