常见PCR方法整理.docVIP

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  • 2023-10-13 发布于江苏
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PCR的普通流程 (以Taq DNA聚合酶为例) 试剂和仪器 1、仪器:PCR仪、移液器、离心管和枪头(121℃灭菌20min,烘干)、冰盒、板架、离心机。 2.ddH2O:三蒸水121℃灭菌20min,4℃保存; 3.Buffer:含Mg2+,10×,-20℃保存; 4.dNTP:保存液为25mM,使用前用ddH2O稀释为2.5mM并分装,避免污染,-20℃保存。 5.引物:引物干粉在溶解前先12,000rpm离心2min,再用ddH2O溶解至10μM,涡旋震荡使其充足溶解,-20℃保存; 6.模板。 7.Taq DNA聚合酶:-20℃保存。 实验准备 1.预订PCR仪,填写好使用时间; 2.制冰; 3.将所需试剂解冻、混匀、瞬离,置于冰上,模板要放在冰上解冻。 环节: 1.设计实验,认真阅读有关试剂阐明书。 2.将离心管置于冰上,按照以下体系加入样品。加样次序为:ddH2O→Buffer/dNTP/引物/模板。 Taq DNA聚合酶反映体系(25μL) 试剂 用量(μL) ddH2O 18.375μL Buffer (Mg2+,10×) 2.5μL dNTP(2.5mM) 2μL 引物(正向和反向,10μM) 各0.5μL 模板DNA 102~105copies Taq DNA聚合酶* 0.125μL * 注意:加酶之前将酶拿出放冰上,使用完立刻放回冰箱。 3.在离心管盖上写好每个样品的编号,瞬离。 4.设立好PCR程序,待反映温度达成实验需要时,将样品放入PCR仪,尽量放在中央的孔。 5.将试剂放回原处,移液器调回最大量程,整顿实验台。 6.反映结束后,及时停止PCR程序(不要停在4℃太久),取出样品,关好PCR仪。 四、 其它注意事项: 1.对的使用移液器、离心机和PCR仪; 2.手或移液器不要接触反映管或试剂瓶、管的内壁、盖内侧; 3.不使用枪头时,盖好枪头盒盖; 4.枪头只能使用一次; 5.合理设计实验,使用适宜的阴性对照很重要,如:使用不加DNA的材料进行PCR扩增,以证明缓冲液或其它试剂中与否存在任何可影响PCR的污染物; 6.如果一次实验需做多管样品,尽量先配制mix,由于存在液体混合后的体积变化和挂液,计算mix用量要比实际管数多某些; 7.反映在PCR仪进行期间,最佳能检查一下程序与否在正常运行,及时发现异常。 3.2 移液器的使用办法 1.调节量程:轻轻旋转量程调节圈,注意不要超出量程。建议从高到低调节量程,必要时,可旋转量程调节圈稍超出所需数值,再向回旋转,移液能够更精确。 2.装配枪头:轻轻按压,将枪头盒上的枪头装配到移液器。 3.吸液:按下操作键至一档(设定体积),将枪头垂直浸入液体约4mm;让操作键慢慢复位,此过程中保持枪头浸入深度,避免吸入空气;将枪头慢慢移出液面,并确保枪头外壁无残留液体。(建议每个新枪头先通过一到三次的吸液和放液来润湿,有助于提高移液精确度。吸取大致积液体时,将枪头保持浸入状态约3秒钟,再移液。) A B 图3.2.1 移液器的吸液(A)和放液(B) 4.放液:将枪头倾斜地紧贴管壁,将操作键慢慢按向一档(设定体积),等待,直到不再有液体流出;将操作键按向二档(吹液),将枪头完全排空;仍然按住操作键,在管壁上擦拭枪头;在管外,慢慢让操作键复位;按下脱卸键卸掉枪头。 5.其它注意事项: (1)轻拿轻放,使用后调回最大量程; (2)保持移液器干净。 (3)与水有很大物理性差别的溶液,或在移液器枪头和液体间存在很大温差的溶液,可能会造成移液不准,要注意检查移液体积。 3.3 PCR反映原理及过程 3.3.1 反映原理 PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物,是运用 DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按 碱基互补配对的原则结合,再调 温度至DNA聚合酶最适反映温度(72°C左右),DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5-3)的方向合成互补链(图3.3.1)。基于聚合酶制造的PCR仪实际就是一种温控设备,能在变性温度,复性温度,延伸温度之间较好地进行控制。 3.5.2 反映过程 PCR由变性--退火--延伸三个基本反映环节构成(图3.3.2):①模板DNA的变性:模板DNA经加热至95℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,方便它与引物结合,为下轮反映作准备;②模板DNA与引物的退火( 复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的 互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在 Taq DNA聚合酶的作用下,以dNTP为反映原料,靶序列为模板,按 碱基互补配对与

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