(12.2.266)--印记基因5个SNP分型及亲代来源的检测.pdfVIP

中国法医学杂志 CHIN J FORENSIC M ED 2012 年第27 卷第6 期 ·论 著 · 印记基因5 个SNP 分型及亲代来源的检测 【摘要】目的 采用复合PCR-Snapshot 联合甲基化敏感酶切技术，检测印记基因中5 个SNP 的甲基化状态、印记亲 代来源及分型。方法 选择15 例亲子鉴定已证实为亲生关系的家系样本，采用单碱基延伸复合检测技术，检测家系样 本IGF2AS rs1003483 、SNURF rs220028 、SNURF rs4906939 、DLGAP2 rs6558478 、SIM2 rs737380 等5 个SNP 分型，同时选用 核酸内切酶(McrBC)和甲基化敏感的限制酶(msRE)HhaI 、HpaII 消化子代DNA ，验证印记基因的亲代来源。结果 经 用本文方法检测，证实rs1003483 为父源印记;rs220028 、rs4906939 为母源印记;rs6558478 及rs737380 未在差异甲基化 区，不能确定其印记亲代来源。结论 复合PCR-Snapshot 联合甲基化敏感酶切技术简单、高效，在检测多个SNP 分型的 同时可确定亲代来源，可在相关研究和实践中选用。 【 关键词】法医物证学;印记基因;甲基化标记;单核苷酸多态性 【中图分类号】DF795. 2 【文献标识码】A 【文章编号】1001 － 5728 (2012)06 － 044 1 － 04 Study on the application of parent-oforigin specific DNA methylation markers to forensic science (Wang Weini1 ，Yang Yaran2 ，Yan Jiangwei2 ，Liu Yacheng3 / 1. School of Forensic Medicine ，Shanxi Medical University ，Taiyuan 03000 1，China ;2. Beij ing Institute of Genomics ，Beij ing 100029 ，China ;3. The Forensic Medical Examination Center ，Beij ing Breau of Public Security ，Beij ing 100 192 ，China) 【Abstract 】Objective To establish a methylation-sensitive enzyme predigestion combine PCR-Snapshot method for SNP genotyping and detecting DNA methylation status in imprinted genes simultaneously． Methods Five SNPs in four imprinted genes (IGF2AS rs1003483 ，SNURF rs220028 ，SNURF rs4906939 ，DLGAP2 rs6558478 ，SIM2 rs737380)were genotyped by minisequencing after multiplex PCR ，and the genomic DNA of 15 blood samples from five trio cases with proven paternity was pretreated with both methylation-sensitive enzyme (HpaII ，HhaI)and endonuclease McrBC to determine the parental origin of alleles． Results For the rs100348