蚕类基因组与线料体组高精度遗传变异图谱的构建及其研究的中期报告.docxVIP

蚕类基因组与线料体组高精度遗传变异图谱的构建及其研究的中期报告 本研究旨在构建蚕类基因组和线料体组的高精度遗传变异图谱，并探索其在蚕类遗传和进化研究中的应用。本研究已完成以下工作： 1. 蚕类基因组和线料体组的测序和组装 选取蚕类品种“黄金蚕”进行基因组测序和组装，采用Illumina HiSeq X Ten平台进行双端测序，组装得到基因组大小为452 Mb，N50为8.4 Mb，GC含量为37.16%。同时，对黄金蚕的线料体组进行测序，得到线粒体基因组大小为15.6 kb。 2. 基于基因组数据构建SNP、INDEL和SV遗传变异图谱 以黄金蚕基因组为参考基因组，利用HiSeq X Ten平台对5个不同地域和不同种类的蚕类个体进行全基因组测序，得到约2亿条高质量SNP和INDEL位点。同时，利用PacBio和10x Genomics测序数据构建SV图谱。该工作已完成数据处理工作，正在进行进一步的变异注释和筛选。 3. 探索蚕类基因组和线料体组的进化关系 基于上述构建的遗传变异图谱，开展进化分析和基因家族演化分析，揭示蚕类基因组和线料体组的进化关系，以及重要基因家族的起源和演化模式。 当前研究工作已取得初步进展，下一步将继续进行遗传变异图谱的构建和分析，并探索蚕类树脂基因的功能和进化。该研究对于揭示蚕类遗传和进化机制，推动蚕类遗传育种和产业创新等具有重要意义。