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蛋白质分子设计

［引言］

蛋白质是一类非常有用的物质，在生物体的进化过程中起着非常重要的作用。

与其它化学试剂比拟：〔1〕分子量非常大；〔2〕在机体内稳定；〔3〕专一性的优劣。

分子生物学的开展弥补了上述缺点，如定位突变、PCR使蛋白质可能工程化生产。蛋白质设计〔蛋白质的构造、功能预测〕涉及多学科的穿插领域，包括材料学、化学、生物学、物理及计算机学科。其应用范围涵盖了药物、食品工业中的酶、污水处理、疫苗、化学传感器等，设计的蛋白质也不仅仅限于20种天然氨基酸，也包括非天然氨基酸、有机/无机模块。

蛋白质设计的目的：〔1〕为蛋白质工程提供指导性信息；〔2〕探索蛋白质的折叠机理。

蛋白质设计分类：〔1〕基于天然蛋白质构造的分子设计；〔2〕蛋白质从头设计。

存在问题：与天然蛋白质比拟：〔1〕缺乏构造独特性；〔2〕缺乏明显的功能优越性。

第一节基于天然蛋白质构造的分子设计

一、概述

蛋白质构造与功能的认识对蛋白质设计至关重要，需要多学科的配合。蛋白质设计循环如下：

计算机模拟基因构建

功能分析 突变蛋白质产品

对要求的活性进展筛选。

.对蛋白质进展表征，如测定序列、三维构造、稳定性及催化活性。

.专一型突变产物。

.计算机模拟。

.蛋白质的三维构造。在PDB中搜索，无纪录即进展X射线、NMR方法或预测并构

建三维构造模型。

6.蛋白质构造与功能的关系。

蛋白质突变体设计的三个主