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中国微生态学杂志年月第卷第期··
20181301ChinJMicroecolJan2018Vol.30No.193
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技术与方法
DNA聚合酶对
PacBioSMRT测序结果影响的评价
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王彦杰徐海燕侯强川马慧敏张和平孙志宏
内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,
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农业部奶制品加工重点实验室内蒙古呼和浩特010018
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摘要目的评估不同DNA聚合酶是否会对以16SrRNA全长为测序靶点的肠道微生物多样性研究结果
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产生影响方法用美国太平洋公司的三代测序仪PacBiosinlemoleculerealtimeseuencintechnolo
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)对份分别采用聚合酶和聚合酶扩增的军犬粪
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便样品进行精确至种水平的测序分析结果经配对MannWhitneU检验显示不同DNA聚合酶
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扩增的同一样品在门属和种水平上差异无统计学意义P0.05然而在某些相对含量较少的操作分
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类单元OTU上其扩增效率存在差异经基于非加权UniFrac距离的非加权组平均法聚类分析和基
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