人类基因组结构变异检测方法及其临床应用_鲍芸.pdf

临床检验杂志２０２３年５月第４１卷第５期ＣｈｉｎＪＣｌｉｎＬａｂＳｃｉ，Ｍａｙ２０２３，Ｖｏｌ．４１，Ｎｏ．５·３５５·

ＤＯＩ：１０．１３６０２／ｊ．ｃｎｋｉ．ｊｃｌｓ．２０２３．０５．０８·综述·

人类基因组结构变异检测方法及其临床应用∗

鲍芸，权静，肖艳群（上海市临床检验中心，上海２００１２６）

摘要：人类基因组结构变异在人类多样性和疾病发生中起着重要作用，许多遗传病都是由染色体结构变异所致。目前临床上

对于结构变异检测主要有染色体核型分析、荧光原位杂交等细胞遗传学方法以及拷贝数变异微阵列芯片和拷贝数变异高通

量测序等分子遗传学方法等。该文旨在介绍几种人类基因组结构变异检测方法在临床上的应用进展，分析其局限性，并对未

来结构变异的临床检测方向进行了展望。

关键词：基因组；结构变异；检测方法；临床应用

中图分类号：Ｒ４４６文献标志码：Ａ

［２⁃３］

人类基因组结构变异（ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｖａｒｉａｔｉｏｎｓ，ＳＶｓ）一般是术，基于单分子标记的全基因组图谱技术（ｂｉｏｎａｎｏ

［４⁃５］

指长度在５０ｂｐ以上的ＤＮＡ片段变化，主要包括插入（ｉｎ⁃ＯＧＭ），第三代长读长测序技术等，这些技术的发展为未

ｓｅｒｔｉｏｎ）、缺失（ｄｅｌｅｔｉｏｎ）、重复（ｄｕｐｌｉｃａｔｉｏｎ）、重复片段扩增来临床检测应用提供了实验依据。由于基因组结构变异的

（ｒｅｐｅａｔｅｘｐａｎｓｉｏｎ）、倒位（ｉｎｖｅｒｓｉｏｎ）、易位（ｔｒａｎｓｌｏｃａｔｉｏｎ）等类型和跨度非常大（５０ｂｐ至整条染色体范围），单一的检测

多种类型。结构变异能够通过多种方式影响基因功能，在方法很难适用于所有变异类型的检测。每种检测方法都有

［６⁃７］

人类多样性和疾病中发挥着重要作用。如发生重复、插入各自优势和局限性，对于不同类型的结构变异检测能力

或缺失等变异时，可能会导致基因剂量的改变；编码区域的也并不一致，因此疾病检出率也各不相同，不同检测方法比

结构变异亦可能会影响基因的转录，改变翻译产物；非编码较见表１。

区域的结构变异，可能会通过位置效应影响基因表达调控；

１细胞遗传学检测方法

当发生增强子或者抑制子删除变异时，也可能会影响基因

的转录水平。当受到基因组结构变异的影响导致某些性状染色体核型分析是以细胞分裂中期染色体为研究对

表现异常时，就会引发各种遗传性疾病。２１号染色体发生象，根据染色体的长度、着丝点位置、长短臂比例、有无随体

重复，由二倍体变为三倍体是唐氏综合征的主要病因；４号等特征，通过染色显带技术对染色体进行分析和比较的技

染色体长臂（４ｑ）末端附近区域部分高度重复片段的缺失是术。核型分析是数十年来临床上传统检测染色体数目异常

诱发面肩肱型肌营养不良症（ｆａｃｉｏｓｃａｐｕｌｏｈｕｍｅｒａｌｍｕｓｃｕｌａｒ和平衡性易位的常用方法，被广泛应用于血液病、不孕不

ｄｙｓｔｒｏｐｈｙ，ＦＳＨＤ）的主要遗传因素；编码ＦⅧ因子的基因片育、产前诊断等领域中染色体异常的筛查与诊断。羊水穿

段内部发生倒位能够引起血友病；部分染色体易位是导致白刺培养后进行核型分析是目前胎儿染色体数目异常和大片

血病的主要原因，如８号和２１号染色体长臂ＡＭＬ⁃ＥＴＯ融合段结