单分子实时测序及其在微生物表观遗传学中的应用_葛元洁.pdf

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微生物学通报Jan.20,2017,44(1):186−199

MicrobiologyChina/wswxtbcn

tongbao@DOI:10.13344/j.microbiol.china.160229

专论与综述

单分子实时测序及其在微生物表观遗传学中的应用

葛元洁陈实

(武汉大学药学院湖北武汉430072)

摘要：表观遗传学对于微生物的生命进程起着重要作用。由限制-修饰系统调控的DNA修饰参

与微生物的免疫防御系统，无限制-修饰系统调控的DNA修饰通过调控基因表达影响表型。然而，

表观遗传信息还没有被常规地作为DNA信息收集分析。基于对DNA合成反应的动力学分析，

单分子实时测序技术可以在获得基本序列数据的同时实现对被修饰核苷酸的检测。这个技术为微

生物中已知DNA修饰的研究提供了新的平台，也为新型DNA修饰的发现做好准备。本文综述

了单分子实时测序技术及其在微生物表观遗传学中的应用。

关键词：单分子实时测序，表观遗传学，DNA修饰

Singlemoleculerealtimesequencinganditsapplicationsin

microbialepigenetics—areview

GEYuan-JieCHENShi

(SchoolofPharmaceuticalSciences,WuhanUniversity,Wuhan,Hubei430072,China)

Abstract:Epigeneticsplaysanimportantroleinbiologicalprocessesofmicroorganisms.DNA

modificationwithrestriction-modificationsystemisacomponentofmicrobialimmunesystem,and

DNAmodificationwithoutrestrictionsysteminfluencesphenotypesbygeneregulation.However,

epigeneticinformationhasnotbeencollectedforDNAsequenceanalysisroutinely.Singlemolecule

realtime(SMRT)sequencing,basedonanalysisofDNAsynthesiskinetics,enablestheacquisitionof

DNAprimarysequencesanddetectionofmodifiednucleotidessimultaneously.Thistechnology

providesanewplatformforresearchonknownDNAmodificationsand

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