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生物技术通报

·技术与方法·BIOTECHNOLOGYBULLETIN()

2018,346:48-53

SMRT测序技术及其在微生物研究中的应用

1，23

唐勇 刘旭

（1.乐山职业技术学院，乐山614000；2.乐山丰野农业科技有限责任公司，乐山614000；3.乐山市农业局，乐山614000）

摘要：高通量测序技术的发展为研究者深入探索微生物世界提供可能。随着以PacificBioSciences（PacBio）公司的单分子

实时测序（Singlemoleculerealtimesequencing，SMRT）为代表的第三代测序（Thirdgenerationsequencing，TGS）技术逐渐发展成熟，

微生物研究方法正面临又一次新的变革。SMRT测序技术凭借其特殊建库方式（SMRTbell）和超长的测序读长等特点，为微生物

16SrRNA基因全长测序提供新的选择。同时，为组装完整可靠的宏基因组和微生物全基因组提供新方法。随着PacBio测序平台的

成本大幅下降，SMRT测序技术的PacBio系列平台开始逐渐被应用于微生物16SrRNA基因测序、宏基因组测序和全基因组测序研

究中。综述了SMRT测序技术的技术原理和特点及其在微生物16SrRNA基因全长测序、宏基因组测序等方面的应用，并分析了目

前SMRT测序技术在微生物各方面研究中的优势和存在的问题，提出基于SMRT测序技术获得的长片段在后期分析中存在的问题。

SMRT测序技术将越来越多地引入到微生物研究中，期望为将要选择使用SMRT测序技术研究微生物的研究人员提供一定参考。

关键词：第三代测序；单分子实时测序；微生物

DOI：10.13560/ki.biotech.bull.1985.2017-1009

SMRTSequencingandItsApplicationinMicroorganismStudies

TANGYong1，2LIUXu3

（1.LeshanVocationalTechnicalCollege，Leshan614000；2.LeshanFengyeAgriculturalTechnologyCO.，LTD，Leshan614000；

3.AgriculturalBureauofLeshan，Leshan614000）

Abstract:Thedevelopmentofhigh-throughputsequencinghasprovidedpowerforresearcherstofurtherexplorethemicroorganism.

Alongwithrapidadvancesofthirdgenerationsequencing（TGS）technologies，especiallysinglemoleculerealtimesequencing（SMRT）

developedbyPacificBioSciences（PacBio），methodsofstudyingmicro-organismaregoingthrougharevolutionarychange.SMRTsequencing

technology，foritsspecialSMRTbellsequencinglibrariesan